183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1067 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1067  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0636  cyclic nucleotide-binding protein  61.24 
 
 		 212 aa  231  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0411  cyclic nucleotide-binding protein  60 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0419  cyclic nucleotide-binding protein  60 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  52.11 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0277  cyclic nucleotide-binding protein  56.84 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3761  cAMP-binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.074854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  33.58 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  31.45 
 
 		 156 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  31.15 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.05 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0116  cyclic nucleotide-binding protein  40.58 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0234  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.12 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.47 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.99 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.52 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0173  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.03 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 		 581 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  29.9 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 598 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 577 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 641 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.09 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  29.93 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.66 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.33 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  29.41 
 
 		 651 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.46 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 		 417 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.44 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  31.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.56 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  34.02 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  24.83 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  25.69 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.22 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.34 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.31 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  37.18 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  24.62 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  34.62 
 
 		 747 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  27.59 
 
 		 739 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 146 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.53 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  25.26 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.37 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  25.2 
 
 		 419 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.66 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.68 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  29.47 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.46 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>