More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3362 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  100 
 
 		 641 aa  1312    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  43.4 
 
 		 651 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  41.19 
 
 		 646 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02625  hypothetical protein  41.89 
 
 		 646 aa  458  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 358 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 594 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 429 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  31.25 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 467 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6388  histidine kinase  28.82 
 
 		 482 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582712  normal  0.0179261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.27 
 
 		 1795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 626 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  30.4 
 
 		 408 aa  140  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  30.4 
 
 		 408 aa  140  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  28.96 
 
 		 505 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  31.03 
 
 		 730 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0368  histidine kinase  28.36 
 
 		 466 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99767  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 680 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  29.72 
 
 		 305 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 679 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  30.06 
 
 		 445 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  31.87 
 
 		 1187 aa  136  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 468 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  30.38 
 
 		 770 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  28.57 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  29.72 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 699 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4589  histidine kinase  26.52 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  32.11 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.98 
 
 		 1901 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 1036 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  30.94 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  30.97 
 
 		 1850 aa  133  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 313 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  28.05 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 627 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 971 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 389 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.87 
 
 		 708 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 470 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 389 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 389 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 389 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 611 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 611 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 358 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  30.21 
 
 		 611 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 358 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 602 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 1146 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  27.92 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3208  sensory transduction protein kinase  27.62 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  30.38 
 
 		 406 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1085  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.0458044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1069  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.998398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 688 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1369  cyclic nucleotide-binding protein  27.33 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.34826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  32.73 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 678 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  30.28 
 
 		 468 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1370  cyclic nucleotide-binding protein  25.64 
 
 		 482 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1096  cyclic nucleotide-binding protein  26.4 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  29.07 
 
 		 724 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.97 
 
 		 1804 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.93 
 
 		 1808 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  27.87 
 
 		 715 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  29.97 
 
 		 1811 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 1021 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  31.66 
 
 		 371 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  25.54 
 
 		 472 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  29.75 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5004  cyclic nucleotide-binding protein  28.48 
 
 		 486 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 1072 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  27.86 
 
 		 457 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 641 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 675 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  26.68 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 928 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.19 
 
 		 1797 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  28.78 
 
 		 601 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.41 
 
 		 1780 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 1465 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 439 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 785 aa  120  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003585  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 445 aa  120  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>