More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1343 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  100 
 
 
468 aa  964    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0368  histidine kinase  49.57 
 
 
466 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99767  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  42.89 
 
 
469 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2254  histidine kinase  33.84 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  32.62 
 
 
485 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6388  histidine kinase  31.54 
 
 
482 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582712  normal  0.0179261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  34.32 
 
 
472 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1369  cyclic nucleotide-binding protein  40.54 
 
 
483 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.34826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5004  cyclic nucleotide-binding protein  37.43 
 
 
486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1085  cyclic nucleotide-binding protein  32.93 
 
 
486 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.0458044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  31.6 
 
 
472 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1069  cyclic nucleotide-binding protein  32.93 
 
 
486 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.998398  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4575  cyclic nucleotide-binding protein  30.9 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1096  cyclic nucleotide-binding protein  32.73 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1370  cyclic nucleotide-binding protein  31.35 
 
 
482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4589  histidine kinase  30.65 
 
 
493 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  35.58 
 
 
463 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  31.91 
 
 
487 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0527  histidine kinase  40.82 
 
 
303 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0458  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 
461 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0622739  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  30.82 
 
 
724 aa  146  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
641 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5447  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  29.23 
 
 
730 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
1036 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  29.27 
 
 
708 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  39.6 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  29.51 
 
 
651 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2299  histidine kinase  26.48 
 
 
542 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
1146 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  41.71 
 
 
1092 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  31.47 
 
 
1934 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2870  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.44 
 
 
1105 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719713  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
646 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
585 aa  133  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  28 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
1021 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.25 
 
 
726 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
1072 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.07 
 
 
1804 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
680 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
971 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
678 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
594 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.24 
 
 
1795 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  29.01 
 
 
433 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
699 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
594 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
602 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  37.24 
 
 
342 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
437 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  38.34 
 
 
458 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
470 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.03 
 
 
2017 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  27.38 
 
 
611 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1465 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  27.86 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.73 
 
 
1780 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  37.17 
 
 
468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  37.29 
 
 
1258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
573 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  37.99 
 
 
248 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
675 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 
920 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  28.31 
 
 
457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  35.02 
 
 
1850 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
589 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
785 aa  120  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.06 
 
 
1805 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  27.08 
 
 
601 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
715 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
928 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  37.43 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  28.53 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  36.07 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
394 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.97 
 
 
804 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
804 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  27.3 
 
 
524 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
571 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.1 
 
 
1901 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  33.33 
 
 
715 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
852 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
439 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  37.78 
 
 
852 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.53 
 
 
1797 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  35.75 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
1942 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
641 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02625  hypothetical protein  31.3 
 
 
646 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  38.64 
 
 
853 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  28.81 
 
 
785 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>