More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0458 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0458  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 461 aa  890    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0622739  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2299  histidine kinase  58 
 
 		 542 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  48.64 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4589  histidine kinase  46.22 
 
 		 493 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6388  histidine kinase  46.12 
 
 		 482 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582712  normal  0.0179261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  44.54 
 
 		 472 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  41.93 
 
 		 485 aa  339  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1369  cyclic nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.34826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5004  cyclic nucleotide-binding protein  40.29 
 
 		 486 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2254  histidine kinase  46.04 
 
 		 478 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1096  cyclic nucleotide-binding protein  42.38 
 
 		 486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1085  cyclic nucleotide-binding protein  42.38 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.0458044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1069  cyclic nucleotide-binding protein  42.38 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.998398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1370  cyclic nucleotide-binding protein  43.04 
 
 		 482 aa  279  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0368  histidine kinase  31.57 
 
 		 466 aa  202  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99767  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  35.21 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4575  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  33.68 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 463 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  28.51 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0527  histidine kinase  43.37 
 
 		 303 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  27.71 
 
 		 708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 797 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  27.44 
 
 		 468 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 678 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 1021 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  25.08 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  29.35 
 
 		 770 aa  126  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  28.85 
 
 		 681 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 594 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  28.88 
 
 		 1187 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 680 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 971 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  28.08 
 
 		 458 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 641 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  30.12 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 920 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 1036 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 585 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 358 aa  117  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  28.31 
 
 		 1850 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  25.24 
 
 		 730 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  34.08 
 
 		 626 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02625  hypothetical protein  29.53 
 
 		 646 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  29.3 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  29.3 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 676 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2233  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.43 
 
 		 747 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4499  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 674 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278807  normal  0.486911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  24.13 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.91 
 
 		 726 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 1146 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 646 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 1072 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  23.84 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 928 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 919 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 537 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 678 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  29.91 
 
 		 305 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 688 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 725 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.78 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 679 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 713 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 1123 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  29.62 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 392 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  22.15 
 
 		 601 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4089  PAS  27.5 
 
 		 678 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.465781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3068  histidine kinase  34.47 
 
 		 485 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.158411  normal  0.556433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 685 aa  106  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.25 
 
 		 833 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  28.01 
 
 		 671 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 675 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>