More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4575 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4575  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 475 aa  961    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  49.68 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2254  histidine kinase  38.05 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4589  histidine kinase  35.17 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  34.27 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  34.82 
 
 		 487 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  34.66 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6388  histidine kinase  36.27 
 
 		 482 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582712  normal  0.0179261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  37.16 
 
 		 472 aa  229  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5004  cyclic nucleotide-binding protein  32.36 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1369  cyclic nucleotide-binding protein  34.03 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.34826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0368  histidine kinase  31.33 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99767  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1370  cyclic nucleotide-binding protein  35.7 
 
 		 482 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  30.9 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0527  histidine kinase  42.91 
 
 		 303 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1085  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.0458044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1096  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1069  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.998398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  28.57 
 
 		 469 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0458  cyclic nucleotide-binding protein  31.24 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0622739  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  29.87 
 
 		 651 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 1021 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 683 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  30.47 
 
 		 626 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 553 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 928 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02625  hypothetical protein  27.95 
 
 		 646 aa  126  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 1146 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 646 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 681 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  36.98 
 
 		 1187 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 594 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 611 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 1036 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 611 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 589 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  35.93 
 
 		 611 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  34.76 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  37.63 
 
 		 358 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 389 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 685 aa  120  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 602 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  33.66 
 
 		 1850 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 678 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 919 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.79 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 627 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  29.43 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 1465 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 524 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 1072 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  37.5 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 675 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 920 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  28 
 
 		 681 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  29.1 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  30.09 
 
 		 305 aa  114  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2299  histidine kinase  35.98 
 
 		 542 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 713 aa  113  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 699 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  24.57 
 
 		 641 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.75 
 
 		 708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  36.76 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 673 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 537 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  25.07 
 
 		 601 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  33.67 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 680 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  33.67 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 585 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.9 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  25.69 
 
 		 730 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  34.39 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 971 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  38.83 
 
 		 673 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 834 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>