More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1369 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1096  cyclic nucleotide-binding protein  79.38 
 
 		 486 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5004  cyclic nucleotide-binding protein  85.89 
 
 		 486 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1369  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 483 aa  998    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.34826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1085  cyclic nucleotide-binding protein  79.38 
 
 		 486 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.0458044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1069  cyclic nucleotide-binding protein  79.38 
 
 		 486 aa  788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.998398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  56.03 
 
 		 487 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4589  histidine kinase  56.46 
 
 		 493 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  52.07 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6388  histidine kinase  51.37 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582712  normal  0.0179261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1370  cyclic nucleotide-binding protein  51.15 
 
 		 482 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  48.74 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2254  histidine kinase  48.45 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0458  cyclic nucleotide-binding protein  41.35 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0622739  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0527  histidine kinase  51.19 
 
 		 303 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2299  histidine kinase  36.42 
 
 		 542 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  40.54 
 
 		 468 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4575  cyclic nucleotide-binding protein  34.03 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  34.43 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0368  histidine kinase  38.73 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99767  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  32.01 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  34.1 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 1021 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 389 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  42.78 
 
 		 389 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  42.78 
 
 		 389 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  42.78 
 
 		 389 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  42.78 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  42.78 
 
 		 389 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  42.78 
 
 		 358 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  37.11 
 
 		 681 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 571 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 971 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  37.37 
 
 		 468 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 594 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 585 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  39.9 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 1465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  27.33 
 
 		 641 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 571 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 573 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 407 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2870  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.98 
 
 		 1105 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719713  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.15 
 
 		 833 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  28.4 
 
 		 730 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 920 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 553 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 537 aa  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 679 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  37.78 
 
 		 1187 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.7 
 
 		 1780 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  35.05 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  41.24 
 
 		 577 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 633 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 577 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  38.22 
 
 		 708 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 713 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  37.63 
 
 		 408 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  37.63 
 
 		 408 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02625  hypothetical protein  27.52 
 
 		 646 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 675 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 688 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 680 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  34.76 
 
 		 1850 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 683 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 1072 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 683 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  27 
 
 		 651 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  36.55 
 
 		 342 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.17 
 
 		 1901 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.14 
 
 		 1797 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 594 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  35.98 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 1123 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  34.29 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 602 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 715 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 1036 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  39.27 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 470 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 440 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  33.72 
 
 		 433 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 611 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.95 
 
 		 1805 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 611 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 763 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  40 
 
 		 406 aa  113  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 646 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.46 
 
 		 1795 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>