More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3195 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  65.97 
 
 		 577 aa  692    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 598 aa  1194    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  56.79 
 
 		 581 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  57.34 
 
 		 583 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  36.02 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  34.33 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  36.27 
 
 		 639 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  29.87 
 
 		 621 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 748 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  29.38 
 
 		 583 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  31.76 
 
 		 1048 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  28.78 
 
 		 1408 aa  186  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1065 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  27.94 
 
 		 1588 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  30.64 
 
 		 1275 aa  164  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  27.67 
 
 		 594 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.35 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.03 
 
 		 323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  34.03 
 
 		 276 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  31.43 
 
 		 1085 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.13 
 
 		 315 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  29.34 
 
 		 1546 aa  130  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  35.64 
 
 		 315 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  34.91 
 
 		 315 aa  127  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.06 
 
 		 263 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  32.33 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30.77 
 
 		 273 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  36.54 
 
 		 760 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  32.73 
 
 		 314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  37.99 
 
 		 256 aa  120  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  35.06 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.06 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  35.06 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  29.92 
 
 		 287 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  37.17 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  35.06 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.48 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.48 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.48 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.48 
 
 		 263 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  34.48 
 
 		 263 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  37.14 
 
 		 275 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  32.7 
 
 		 320 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  40.96 
 
 		 323 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.74 
 
 		 250 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  32.7 
 
 		 320 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.48 
 
 		 263 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  36.68 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  39.66 
 
 		 300 aa  115  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  39.56 
 
 		 320 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.43 
 
 		 275 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.62 
 
 		 260 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  28.7 
 
 		 751 aa  114  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  36.31 
 
 		 259 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  38.89 
 
 		 335 aa  114  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.6 
 
 		 728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  35.29 
 
 		 327 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  37.5 
 
 		 280 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  37.84 
 
 		 326 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.74 
 
 		 735 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  38.51 
 
 		 324 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  39.78 
 
 		 316 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  39.78 
 
 		 316 aa  112  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  37.02 
 
 		 311 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  39.44 
 
 		 347 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  29.43 
 
 		 735 aa  110  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  39.51 
 
 		 347 aa  110  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  32.55 
 
 		 754 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36 
 
 		 275 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  41.11 
 
 		 343 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.96 
 
 		 253 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  37.02 
 
 		 333 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  36.19 
 
 		 803 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  36.19 
 
 		 803 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.71 
 
 		 748 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  36.19 
 
 		 803 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  38.76 
 
 		 343 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.29 
 
 		 734 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  36.19 
 
 		 738 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  38.33 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.27 
 
 		 741 aa  109  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  39.44 
 
 		 390 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  36.67 
 
 		 798 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  36.67 
 
 		 796 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  37.93 
 
 		 262 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.02 
 
 		 320 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.02 
 
 		 320 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  38.07 
 
 		 329 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  38.85 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.92 
 
 		 727 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  38.33 
 
 		 343 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  28.03 
 
 		 737 aa  107  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27.59 
 
 		 733 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  38.33 
 
 		 345 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  39.33 
 
 		 317 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  39.1 
 
 		 291 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  26.6 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  35.75 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>