More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3110 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 748 aa  1486    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  33.39 
 
 		 639 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 581 aa  203  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 624 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  31.24 
 
 		 599 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 597 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 583 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  27.2 
 
 		 1588 aa  191  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 		 598 aa  187  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  29.65 
 
 		 621 aa  181  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  29.71 
 
 		 1085 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  27.13 
 
 		 584 aa  164  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  31.29 
 
 		 583 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  26.52 
 
 		 1408 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1065 aa  154  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  28.96 
 
 		 1546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  27.13 
 
 		 594 aa  132  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  26.93 
 
 		 1275 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  26.71 
 
 		 1048 aa  129  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  44.37 
 
 		 273 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  31.05 
 
 		 323 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  43.71 
 
 		 262 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  30.07 
 
 		 323 aa  111  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  30.99 
 
 		 314 aa  110  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  43.83 
 
 		 300 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  35.96 
 
 		 760 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.98 
 
 		 263 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35 
 
 		 260 aa  108  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  31.47 
 
 		 315 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.37 
 
 		 263 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  39.38 
 
 		 327 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  31.47 
 
 		 315 aa  106  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  29.04 
 
 		 728 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  37.22 
 
 		 345 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.48 
 
 		 315 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  36.31 
 
 		 330 aa  105  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.48 
 
 		 324 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  40.88 
 
 		 253 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  31.91 
 
 		 327 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  35.37 
 
 		 263 aa  104  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.76 
 
 		 263 aa  104  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  35.37 
 
 		 263 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  36.87 
 
 		 346 aa  103  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  33.33 
 
 		 754 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  34.45 
 
 		 320 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  35.56 
 
 		 302 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  36.67 
 
 		 346 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.05 
 
 		 256 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  41.36 
 
 		 263 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.76 
 
 		 263 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.15 
 
 		 263 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.76 
 
 		 263 aa  103  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.76 
 
 		 263 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.97 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  30.46 
 
 		 728 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  40.35 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.76 
 
 		 263 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  34.97 
 
 		 275 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  36.67 
 
 		 368 aa  103  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  34.08 
 
 		 275 aa  102  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.41 
 
 		 320 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  27.44 
 
 		 263 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  37.11 
 
 		 728 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  38.33 
 
 		 323 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  36.22 
 
 		 348 aa  101  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  34.24 
 
 		 251 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  40.36 
 
 		 311 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.08 
 
 		 275 aa  100  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  35 
 
 		 250 aa  100  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  36.73 
 
 		 738 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.57 
 
 		 727 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.76 
 
 		 323 aa  99.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  36.36 
 
 		 326 aa  99.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  38.38 
 
 		 734 aa  99.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.75 
 
 		 346 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  35.52 
 
 		 327 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  38.66 
 
 		 748 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  36.56 
 
 		 319 aa  98.6  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  40.56 
 
 		 310 aa  97.8  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  34.59 
 
 		 305 aa  97.8  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.75 
 
 		 741 aa  97.4  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37.97 
 
 		 305 aa  97.8  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37.97 
 
 		 306 aa  97.8  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37.97 
 
 		 305 aa  97.8  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  39.2 
 
 		 280 aa  97.4  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  38.61 
 
 		 302 aa  97.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.34 
 
 		 728 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.34 
 
 		 751 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.34 
 
 		 728 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.33 
 
 		 733 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.97 
 
 		 308 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  40.37 
 
 		 343 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.66 
 
 		 753 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  35.83 
 
 		 318 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  35.88 
 
 		 314 aa  95.9  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  35.83 
 
 		 318 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.7 
 
 		 335 aa  95.9  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  39.49 
 
 		 323 aa  95.5  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.97 
 
 		 302 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>