More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2455 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 594 aa  1172    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 624 aa  227  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  31.28 
 
 		 621 aa  210  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  33.45 
 
 		 639 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 584 aa  188  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  30.58 
 
 		 599 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  29 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  29.36 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  29.29 
 
 		 583 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  29.48 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 748 aa  150  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  25.82 
 
 		 1588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  24.34 
 
 		 1408 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  27.67 
 
 		 598 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  28.23 
 
 		 1085 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  29.41 
 
 		 1275 aa  124  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1065 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  26.72 
 
 		 1048 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  36.52 
 
 		 267 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  27.42 
 
 		 1546 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  34.07 
 
 		 262 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  36.16 
 
 		 259 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  28.76 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  35.76 
 
 		 257 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  28.07 
 
 		 256 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1026  patatin family phospholipase  38.41 
 
 		 171 aa  99.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  27.69 
 
 		 323 aa  98.2  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  27.04 
 
 		 323 aa  95.9  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  35.03 
 
 		 265 aa  95.1  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  26.44 
 
 		 260 aa  94  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  32 
 
 		 250 aa  93.6  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  34.62 
 
 		 335 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  28.12 
 
 		 256 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.07 
 
 		 311 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  32.12 
 
 		 280 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  25.78 
 
 		 253 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  30.27 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.28 
 
 		 263 aa  87  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.28 
 
 		 263 aa  87  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.84 
 
 		 263 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  35.15 
 
 		 324 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.28 
 
 		 263 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  30.13 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  32.39 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4236  patatin  34.78 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4392  patatin  34.78 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4170  patatin  34.78 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  35.59 
 
 		 311 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.1 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  31.28 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  26.75 
 
 		 734 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.56 
 
 		 738 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  33.69 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.62 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  26.55 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.03 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.73 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.73 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.73 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  33.15 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  33.15 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  33.15 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  25.67 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  33.15 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  33.15 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  33.15 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  33.15 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  33.15 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.17 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  33.15 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  31.62 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  31.67 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  33.77 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  38.56 
 
 		 328 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  33.33 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  29.77 
 
 		 738 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.25 
 
 		 327 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.28 
 
 		 263 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  29.77 
 
 		 738 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  34.22 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  29.77 
 
 		 738 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  29.77 
 
 		 738 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  30.73 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  29.3 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.28 
 
 		 735 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  30.24 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  31.41 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  29.3 
 
 		 738 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  29.3 
 
 		 738 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.95 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  29.77 
 
 		 736 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  27.64 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  33.52 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  31.22 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  35.39 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.25 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  31.28 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  33.16 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>