More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4153 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4153  Patatin  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  57.2 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  55 
 
 		 277 aa  254  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  53.68 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  53.31 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  55.39 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  48.86 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  38.01 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  36.86 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  36.75 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  36.97 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  36.08 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  36.17 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  35.69 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  38.91 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  36.44 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  35.47 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  37.77 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  37.24 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  31.75 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  34.85 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  30.71 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.3 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  38.33 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  33.5 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  36.17 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  35.68 
 
 		 348 aa  99  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  37.78 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.22 
 
 		 335 aa  95.5  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  34.05 
 
 		 345 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.22 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  34.04 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 583 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  35.14 
 
 		 373 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.59 
 
 		 322 aa  92.4  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.59 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  35.67 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  35.67 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  34.05 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  33.87 
 
 		 390 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  35.96 
 
 		 357 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.51 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  35.56 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  35.58 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  36.02 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  34.41 
 
 		 368 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  32.43 
 
 		 343 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  31.48 
 
 		 347 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  32.61 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  32.61 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  34.91 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  31.34 
 
 		 336 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  35.68 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  38.01 
 
 		 326 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  33.51 
 
 		 333 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  34.33 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  32.78 
 
 		 343 aa  85.5  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  33.95 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.47 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  29.65 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  32 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  33.68 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.51 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  30.73 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  35.83 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.51 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  31.76 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  32.8 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  30.77 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.72 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  35.63 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  32.97 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  28.95 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  28.95 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  28.95 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  28.95 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.62 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  35.29 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  29.77 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  34.66 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  31.89 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  26.47 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  35.23 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  35.23 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  35.23 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  35.23 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  28.5 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.5 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  27.09 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  28.08 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.26 
 
 		 597 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  34.71 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  28.08 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  29.85 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  29.85 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>