More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5145 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  100 
 
 		 294 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  72.82 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  61.79 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  61.43 
 
 		 312 aa  343  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  62.19 
 
 		 306 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  61.43 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  61.84 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  56.79 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  48.57 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  48.03 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  44.25 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  41.79 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  36.47 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  36.75 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  36.3 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  33.69 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  34.44 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  40.7 
 
 		 317 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  37.44 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  30.56 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  31.35 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  42.33 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  27.57 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  38.38 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  37.7 
 
 		 322 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  38.25 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  37.57 
 
 		 347 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  38.2 
 
 		 348 aa  99  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  33.06 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  36.78 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  30.4 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.87 
 
 		 727 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  27.05 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.07 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  38.2 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  28.73 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33.15 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  38.2 
 
 		 390 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.15 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  31.69 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  28.74 
 
 		 754 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.08 
 
 		 320 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.87 
 
 		 751 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.62 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  27.89 
 
 		 728 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.87 
 
 		 728 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.87 
 
 		 728 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.59 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  27.43 
 
 		 741 aa  92.8  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.19 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  37.57 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.81 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  31.7 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  33.52 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  31.62 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  33.33 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  33.52 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  36.26 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  29.55 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.3 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  28.52 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  26.92 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  35.36 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.3 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  25.82 
 
 		 735 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  30.17 
 
 		 734 aa  89.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  29.31 
 
 		 738 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  34.42 
 
 		 352 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  29.31 
 
 		 737 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  29.31 
 
 		 738 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  26.05 
 
 		 738 aa  89  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  26.71 
 
 		 751 aa  89  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  29.87 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  29.87 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  34.42 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  35.56 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  34.87 
 
 		 764 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.87 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.7 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  35.56 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.45 
 
 		 738 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.45 
 
 		 738 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  31.33 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  31.5 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  29.44 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.44 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.44 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  30.56 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  36.26 
 
 		 267 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  37.06 
 
 		 352 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.44 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.56 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  27.97 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.44 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  27.97 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27.97 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.92 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  28.88 
 
 		 738 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  26.64 
 
 		 737 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.82 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>