More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4848 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4848  patatin  100 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  58.56 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  47.57 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  43.54 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  41.94 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  41.79 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  41.04 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  38.95 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  40.42 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  41.84 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  41.8 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  41.8 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  36.44 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  35.88 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  38.21 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  31.56 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  29.59 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  32.17 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  34.62 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  35.08 
 
 		 357 aa  92.4  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.29 
 
 		 728 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  27.64 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  30.73 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  29.82 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  29.64 
 
 		 727 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.2 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  27.2 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  34.39 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30.59 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  30.59 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.18 
 
 		 728 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  30.59 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.7 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.98 
 
 		 751 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.07 
 
 		 728 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  33.15 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.22 
 
 		 748 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  34.73 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  28.89 
 
 		 777 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  29.21 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.08 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.39 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  31.76 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  28.94 
 
 		 790 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.52 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  27.27 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  28.68 
 
 		 753 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  28.52 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  26.64 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  25.1 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  26.85 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  31.34 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  25.58 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.24 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  32.51 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  28.52 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  31.61 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1690  Patatin  28.16 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  34.27 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  23.08 
 
 		 741 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  29.53 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  30.26 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  24.44 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  27.82 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  30.29 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.82 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  23.89 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  28.93 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.03 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  29.5 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  23.66 
 
 		 751 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.2 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  29.03 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  26.54 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  32.28 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1538  patatin  32.73 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.546797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  24.47 
 
 		 735 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  31.28 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  30.05 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  30.05 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  24.9 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  30.05 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  28.25 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  36.59 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  32.04 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  30.05 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  24.32 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  27.8 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  23.11 
 
 		 740 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  32.04 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  32.4 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  24.21 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  27.42 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  33.14 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  27.27 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  24.09 
 
 		 720 aa  72.4  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  27.72 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  27.72 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>