More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2085 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2085  patatin  100 
 
 		 314 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  48.03 
 
 		 294 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  47.57 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  49.24 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  49.62 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  47.99 
 
 		 310 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  48.12 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  48.3 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  51.57 
 
 		 303 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  49.41 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  49.41 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  45.45 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  40.31 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  39.11 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  37.24 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  36.03 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  38.35 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  42.31 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  39.91 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  28.98 
 
 		 741 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  45.74 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.89 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.37 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.37 
 
 		 760 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  32.95 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  34.11 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  34.38 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.06 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  34.38 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  40.59 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  36.04 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  33.96 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  35.81 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  39.77 
 
 		 265 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  30.04 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.24 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  37.5 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  32.94 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  41.38 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  41.32 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  41.32 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  36.26 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  33.86 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.98 
 
 		 727 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  33.59 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.61 
 
 		 735 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.12 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  38.92 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.95 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  33.14 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  31.89 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  32.4 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  28.78 
 
 		 751 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.84 
 
 		 263 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.77 
 
 		 754 aa  99  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.43 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  37.28 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.43 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.37 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.43 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.43 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.02 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  32.05 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.43 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  37.71 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  39.52 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.43 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.2 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  39 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.68 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  28.09 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.63 
 
 		 728 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.63 
 
 		 728 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29.78 
 
 		 738 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31 
 
 		 728 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  29.96 
 
 		 252 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  30.39 
 
 		 790 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  30.71 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  29.39 
 
 		 776 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  23.62 
 
 		 256 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  38.24 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  30.4 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.36 
 
 		 767 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.94 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  34.64 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.8 
 
 		 734 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  30.65 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  35.71 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  39.76 
 
 		 352 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.14 
 
 		 753 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.28 
 
 		 751 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.56 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.56 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.56 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  36.69 
 
 		 259 aa  93.2  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  36.52 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  32.17 
 
 		 241 aa  92.4  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.95 
 
 		 347 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.96 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 728 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>