More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6465 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6465  patatin  100 
 
 		 286 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  62.89 
 
 		 277 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  61.57 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  55.39 
 
 		 277 aa  262  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  53.51 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  53.51 
 
 		 276 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  47.17 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  42.63 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  38.16 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  35.45 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  42.33 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  37.98 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  40 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  35.04 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  39.15 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  42.25 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  34.19 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  40.21 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  33.21 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  31.32 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  33.77 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  35.59 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  32.84 
 
 		 343 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  35.68 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.72 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  35.71 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.71 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  38.46 
 
 		 347 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.62 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.3 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  34.01 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  33.65 
 
 		 387 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  35.21 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  34.01 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  37.36 
 
 		 348 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  34.01 
 
 		 474 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  34.01 
 
 		 347 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  36.26 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  34.18 
 
 		 347 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  36.27 
 
 		 390 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  32.99 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  34.62 
 
 		 386 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.73 
 
 		 746 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  33.95 
 
 		 317 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  34.81 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  32.98 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  34.29 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  34.43 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  36.31 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  32.82 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  34.87 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  35.33 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.6 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.29 
 
 		 760 aa  82.8  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  34.78 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  30.24 
 
 		 400 aa  82.4  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.77 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.89 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  35.94 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  31.77 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.56 
 
 		 790 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  31.77 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.77 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  33.7 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  34.36 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  34.36 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  33.69 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  34.36 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  34.36 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  30.5 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  32.63 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.67 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  30.1 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  33.69 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  30.5 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.19 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  31.44 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.53 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  28.17 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  30.56 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  32.24 
 
 		 399 aa  79  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.82 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  32.66 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  31.71 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  33.33 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.28 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.67 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.09 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.38 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.37 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  35.91 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.04 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  29.47 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  33.53 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  31.66 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 		 583 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  29.47 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  32.96 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  30 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.77 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>