More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0386 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0386  patatin  100 
 
 
387 aa  787    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  67.72 
 
 
387 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  65.69 
 
 
418 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  53.41 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  55.43 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  55.15 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  55.43 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  54.42 
 
 
400 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  55 
 
 
382 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  52.21 
 
 
399 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  51.19 
 
 
386 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  43.94 
 
 
378 aa  276  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  40.17 
 
 
410 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  39.59 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  39.59 
 
 
412 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  37.77 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  39.61 
 
 
390 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  39.34 
 
 
412 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  39.34 
 
 
412 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  39.34 
 
 
412 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  39.34 
 
 
412 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  39.34 
 
 
412 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  39.34 
 
 
412 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  39.34 
 
 
390 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  39.68 
 
 
399 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  40.33 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  38.81 
 
 
429 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  39.62 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  36.91 
 
 
420 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  36.91 
 
 
420 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  42.07 
 
 
387 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  39.01 
 
 
405 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  39.01 
 
 
405 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  39.01 
 
 
405 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  37.74 
 
 
377 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  38.74 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  38.74 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  38.48 
 
 
371 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  39.35 
 
 
382 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  38.19 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  39.01 
 
 
405 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  36.24 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  37.99 
 
 
405 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  37.57 
 
 
384 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  40.17 
 
 
403 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  36.71 
 
 
386 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  38.94 
 
 
390 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  36.44 
 
 
386 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  39.44 
 
 
384 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  41.03 
 
 
379 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  41.48 
 
 
391 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  40.33 
 
 
374 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  40.17 
 
 
390 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  36.49 
 
 
378 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  37.4 
 
 
427 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  40.4 
 
 
385 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  35.31 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  36.87 
 
 
423 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  40.24 
 
 
385 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  38.58 
 
 
390 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.32 
 
 
763 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 
765 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  39.81 
 
 
394 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  34.18 
 
 
357 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.13 
 
 
777 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  32.08 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  32.16 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  36.57 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.5 
 
 
757 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  32.27 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.5 
 
 
757 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.5 
 
 
757 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.5 
 
 
757 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.5 
 
 
757 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.88 
 
 
757 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.5 
 
 
757 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.5 
 
 
757 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  31.79 
 
 
341 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  36.17 
 
 
365 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.34 
 
 
334 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  34.81 
 
 
356 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  29.6 
 
 
339 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  32.71 
 
 
346 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  29.72 
 
 
357 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  34.1 
 
 
414 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  31.93 
 
 
382 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  34.1 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  33.22 
 
 
382 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  32.79 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.13 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  30.96 
 
 
347 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  32.14 
 
 
362 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  34.33 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.58 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  30.43 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  29.94 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  29.97 
 
 
349 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  31.56 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  26.38 
 
 
332 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  31.87 
 
 
343 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>