More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2824 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  100 
 
 		 357 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  36.11 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.65 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  32.75 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  37.21 
 
 		 308 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  32.84 
 
 		 283 aa  99.8  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  36.78 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  35.16 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  24.63 
 
 		 263 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  35.19 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  31.98 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  36.75 
 
 		 263 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  33.14 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  35.08 
 
 		 290 aa  92.8  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  35.96 
 
 		 277 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  37.08 
 
 		 310 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30.83 
 
 		 273 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  25.18 
 
 		 263 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.05 
 
 		 250 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  32.58 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  32.06 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  34.73 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  33.55 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  30.23 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  35.71 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  28.5 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  35.76 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  32.9 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  32.72 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  31.18 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  34.42 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  32.26 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  27.5 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  28 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.7 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.5 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  27.5 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  27.5 
 
 		 263 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  27.5 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  31.43 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  27.5 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  30.7 
 
 		 276 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  32.74 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  31.43 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  31.1 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  28.31 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  31.98 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  35.12 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  30.23 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.45 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.24 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.43 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  28.72 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  34.52 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  32.88 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  32.14 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  28.07 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  28.27 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  32.88 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  32.88 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  31.25 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  25.88 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  31.51 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  25.88 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  34.81 
 
 		 262 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  33.93 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1632  Patatin  35.75 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  29.84 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  31.29 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.53 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.24 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.57 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  32.34 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  28.76 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  29.09 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  31.98 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  28.39 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.5 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.36 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1538  patatin  30.82 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.546797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  30.64 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  26.73 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.82 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  31.36 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.53 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  31.51 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  31.51 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  31.51 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.53 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  31.51 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  36.09 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.82 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.82 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  29.63 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  28.29 
 
 		 803 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  28.29 
 
 		 803 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>