More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22400 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22400  Patatin  100 
 
 
343 aa  689    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  33.5 
 
 
277 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  26.91 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  26.04 
 
 
399 aa  92.8  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  28.07 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  31.32 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  30.09 
 
 
291 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  27.22 
 
 
405 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  32.09 
 
 
387 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  29.5 
 
 
387 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  31.39 
 
 
410 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.78 
 
 
378 aa  89.4  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  27.05 
 
 
382 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  26.82 
 
 
418 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.76 
 
 
765 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  28.47 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  30.86 
 
 
421 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  30.89 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  31.56 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  29.17 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  30.5 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  28.72 
 
 
374 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  29.76 
 
 
313 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  28.37 
 
 
374 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  28.37 
 
 
374 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  29.88 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  25.61 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  29.88 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  31 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  28.03 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  31 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  31 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  27.93 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  28.38 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  28.52 
 
 
387 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  31.98 
 
 
377 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  29.07 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  29.07 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  28.52 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  29.07 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  29.07 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.61 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  30.57 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  30.57 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.37 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  26.43 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  26.92 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  29.21 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  26.92 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  26.43 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  30 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  31.51 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  27.67 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  31.03 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  26.79 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.13 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  26.09 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.39 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  32.04 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.39 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.39 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.39 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  28.57 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  27.87 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  27.8 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  32.76 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.85 
 
 
777 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  28.47 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  24.73 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  25.42 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  28.29 
 
 
283 aa  79.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  29.58 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  27.08 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  30.28 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  25 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.41 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.44 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.41 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.3 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.41 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.44 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.44 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.44 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  28.93 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  28.35 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  27.67 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  31.65 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  25.36 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  30.28 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.88 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  29.87 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  24.73 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  30.77 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.24 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  24.14 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  24.24 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>