More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5313 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5313  patatin  100 
 
 
405 aa  842    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  82.28 
 
 
412 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  82.28 
 
 
412 aa  705    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  96.3 
 
 
405 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  84.57 
 
 
390 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  82.28 
 
 
412 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  82.28 
 
 
412 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  82.28 
 
 
412 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  93.58 
 
 
405 aa  767    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  84.31 
 
 
390 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  96.54 
 
 
405 aa  821    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  82.04 
 
 
412 aa  703    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  96.3 
 
 
405 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  96.3 
 
 
405 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  96.3 
 
 
405 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  70.43 
 
 
412 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  70.43 
 
 
412 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  67.44 
 
 
417 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  62.63 
 
 
420 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  62.63 
 
 
420 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  60.49 
 
 
377 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  55.76 
 
 
417 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  54.4 
 
 
427 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  56.76 
 
 
429 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  54.57 
 
 
423 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  56.23 
 
 
442 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  55.91 
 
 
410 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  49.46 
 
 
389 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  50.42 
 
 
390 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  48.65 
 
 
378 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  49.32 
 
 
403 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  47.23 
 
 
387 aa  319  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  49.06 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  47.23 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  48.38 
 
 
391 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  44.18 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  51.44 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  45.99 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  46.07 
 
 
382 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  45.15 
 
 
385 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  46.05 
 
 
390 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  46.13 
 
 
378 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  47.03 
 
 
385 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  44.86 
 
 
384 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  44.09 
 
 
394 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  40.11 
 
 
371 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  39.83 
 
 
371 aa  260  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  39.02 
 
 
399 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  38.67 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  38.67 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  39.38 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  39.47 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  38.66 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  39.83 
 
 
399 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  39.68 
 
 
382 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  37.37 
 
 
387 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  39.01 
 
 
387 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  40.79 
 
 
379 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  37.94 
 
 
365 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  39.11 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  39.55 
 
 
379 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  39.11 
 
 
379 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  37.43 
 
 
357 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  36.29 
 
 
358 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  35.95 
 
 
341 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  35.95 
 
 
341 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  34.19 
 
 
341 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  36.68 
 
 
356 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.96 
 
 
765 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.19 
 
 
763 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  33.14 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.57 
 
 
777 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  32.43 
 
 
334 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  32.43 
 
 
339 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.66 
 
 
757 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.66 
 
 
757 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.66 
 
 
757 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.66 
 
 
757 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.66 
 
 
757 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.66 
 
 
757 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.66 
 
 
757 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.27 
 
 
757 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  27.19 
 
 
346 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  29.5 
 
 
375 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.93 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  27.59 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  28.09 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  28.09 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  27.93 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  28.04 
 
 
355 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  25.14 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  27.59 
 
 
414 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  30.54 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  29.25 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  29.86 
 
 
341 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  30.59 
 
 
343 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  29.51 
 
 
350 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.22 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  27.6 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  26.45 
 
 
349 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>