293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0706 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  703    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  703    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  57.74 
 
 
355 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  53.75 
 
 
349 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  53.71 
 
 
353 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  53.45 
 
 
349 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  53.75 
 
 
349 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  50.15 
 
 
349 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  47.01 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  47.9 
 
 
358 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  49.25 
 
 
346 aa  341  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  45.95 
 
 
360 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  45.86 
 
 
349 aa  329  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  46.55 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  46.41 
 
 
375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  45.1 
 
 
354 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  45.4 
 
 
382 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  45.19 
 
 
346 aa  315  7e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  43.27 
 
 
341 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  42.73 
 
 
375 aa  305  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  45.51 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  44.48 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  42.21 
 
 
345 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  42.17 
 
 
346 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  42.17 
 
 
346 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  42.94 
 
 
357 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  43.82 
 
 
350 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  45.77 
 
 
433 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  44.76 
 
 
444 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  42.86 
 
 
414 aa  292  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  44.88 
 
 
386 aa  291  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  42.86 
 
 
414 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  43.71 
 
 
405 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  42.47 
 
 
382 aa  288  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  41.53 
 
 
343 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  44.41 
 
 
347 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  43.77 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  44.65 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  41.69 
 
 
344 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  39.22 
 
 
340 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  39.94 
 
 
383 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  38.21 
 
 
365 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  41.4 
 
 
342 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  37.01 
 
 
384 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  40.18 
 
 
348 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  39.71 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  36.69 
 
 
362 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  37.87 
 
 
346 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  38.42 
 
 
346 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  36.2 
 
 
352 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  38.66 
 
 
351 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  35.82 
 
 
370 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  30.94 
 
 
470 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  35.81 
 
 
309 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  29.59 
 
 
349 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  29.18 
 
 
321 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  30.41 
 
 
354 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  29.39 
 
 
442 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  29.41 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  28.13 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  26.89 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  29.15 
 
 
330 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.88 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.04 
 
 
378 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  31.25 
 
 
389 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  26.27 
 
 
371 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  29.26 
 
 
412 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.5 
 
 
387 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.26 
 
 
334 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  29.85 
 
 
442 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  25.34 
 
 
365 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  28.27 
 
 
399 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  29.89 
 
 
339 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  28.08 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  29 
 
 
417 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  27.12 
 
 
420 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  27.12 
 
 
420 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  31.46 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  29.96 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  28.09 
 
 
405 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  25.97 
 
 
405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  25.97 
 
 
405 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  26.27 
 
 
405 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  26.27 
 
 
405 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  26.27 
 
 
405 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  26.37 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  29.1 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  30.92 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  29.92 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  29.81 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  29.48 
 
 
403 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  29.43 
 
 
427 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.71 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.71 
 
 
390 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.71 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.71 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.71 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  26.67 
 
 
417 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.71 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.62 
 
 
412 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>