265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2026 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2026  patatin  100 
 
 		 362 aa  740    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  75.72 
 
 		 384 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  59.4 
 
 		 383 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  55.12 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  51.3 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  50.44 
 
 		 348 aa  325  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  50.73 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  44.41 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  44.41 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  43.4 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  43.24 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  42.06 
 
 		 349 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  42.4 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  44.35 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  41.04 
 
 		 347 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  43.77 
 
 		 382 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  43.03 
 
 		 346 aa  271  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  41.87 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  43.48 
 
 		 343 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  42.18 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  42.65 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  42.77 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  42.65 
 
 		 414 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  42.2 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  42.18 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  43.5 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  42.54 
 
 		 350 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  41.38 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  40.52 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  36.69 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  36.69 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  40.87 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  40.51 
 
 		 405 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  41.42 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  41.55 
 
 		 341 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  40.79 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  41.1 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  38.04 
 
 		 444 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  40.51 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  41.36 
 
 		 346 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  40.23 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  41.08 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  39.72 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  41.64 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  39.19 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  38.01 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  40 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  35.65 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  38.78 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  36.39 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  34.66 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  34.59 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  33.43 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  35.66 
 
 		 309 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  30.09 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  28.57 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  28.57 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  30.91 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  29.64 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  29.55 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  29.25 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  28.41 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  29.01 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  30.6 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  31.15 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  33.21 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  32.14 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.06 
 
 		 763 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  31.13 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  29.32 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  28.76 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  31.97 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  28.09 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  32.81 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  28.09 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  32.17 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  31.09 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  31.37 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.82 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  28.03 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  23.74 
 
 		 356 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  29.48 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  28.97 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  26.78 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  28.97 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  30.33 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.04 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  30.56 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  27.86 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.92 
 
 		 757 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  30.98 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  30.04 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  27.21 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  28.11 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  30.38 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.04 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>