284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0742 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  100 
 
 		 346 aa  703    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  99.13 
 
 		 346 aa  698    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  74.65 
 
 		 365 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  75.35 
 
 		 345 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  70.03 
 
 		 343 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  54.85 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  54.55 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  52.22 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  45.36 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  48.44 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  47.73 
 
 		 433 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  47.67 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  42.17 
 
 		 341 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  42.17 
 
 		 341 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  44.72 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  44.63 
 
 		 353 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  46.09 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  41.95 
 
 		 354 aa  285  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  44.35 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  42.21 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  45.14 
 
 		 358 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  42.37 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  44.06 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  42.66 
 
 		 349 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  46.13 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  42.45 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  42.02 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  46.76 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  46.24 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  46.02 
 
 		 382 aa  272  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  44.8 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  44.6 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  44.6 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  43.31 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  39.94 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  42.77 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  42.77 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  41.64 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  40.39 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  41.95 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  41.74 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  40.22 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  42.4 
 
 		 341 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  43.84 
 
 		 348 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  43.57 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  41.36 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  39.04 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  38.92 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  43.5 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  40.95 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  41.6 
 
 		 346 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  36.24 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  34.47 
 
 		 470 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  34.76 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  33.93 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  34.21 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  35.44 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  30.34 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  28.61 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  33.65 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  30.42 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  26.46 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  31.36 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.83 
 
 		 763 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.48 
 
 		 429 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.08 
 
 		 765 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.05 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  26.82 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  32.37 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  31.49 
 
 		 417 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.18 
 
 		 410 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  28.71 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.38 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  30.48 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  28.28 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.73 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  29.41 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  29.89 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.03 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.8 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  28.74 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  30.85 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  29.05 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  29.05 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  29.96 
 
 		 420 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  29.05 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  29.05 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  29.05 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  29.05 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  29.05 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  29.96 
 
 		 420 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  31.09 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  29.63 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  30.6 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  29.05 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  37.31 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  29.71 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  30.6 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  29.81 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  29.7 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>