More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5048 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5048  patatin  100 
 
 		 386 aa  772    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  79.9 
 
 		 382 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  67.15 
 
 		 375 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  66.67 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  64.71 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  65.4 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  53.89 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  52.98 
 
 		 354 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  56.12 
 
 		 346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  48 
 
 		 343 aa  319  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  50.44 
 
 		 357 aa  315  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  47.92 
 
 		 375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  45.77 
 
 		 359 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  45.1 
 
 		 353 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  46.8 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  46.46 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  46.51 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  43.55 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  44.61 
 
 		 355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  46 
 
 		 444 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  47.45 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  44.88 
 
 		 341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  44.88 
 
 		 341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  46.69 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  46.7 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  46.7 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  45.43 
 
 		 345 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  47.03 
 
 		 394 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  46.9 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  43.24 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  43.82 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  48.48 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  46.74 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  46.27 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  43.25 
 
 		 365 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  42.43 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  47.79 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  42.86 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  42.98 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  44.41 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  45.75 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  41.57 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  41.94 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  42.51 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  40.29 
 
 		 348 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  42.86 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  43.45 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  42.32 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  44.55 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  40.74 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  35.1 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  38.89 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  34.39 
 
 		 470 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  41.46 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  34.04 
 
 		 321 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  33.14 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  38.37 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  36.28 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  31.4 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  30.4 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  30.23 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  33.44 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  30.77 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  31.94 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  32.06 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  31.72 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  30.85 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  32.94 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.07 
 
 		 763 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  30.15 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 		 765 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  31.92 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  31.62 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  30.48 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.66 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  32.79 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  31.43 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  29.9 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  31.62 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.43 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.61 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  33.33 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  31.08 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  33.33 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  31.03 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  31.18 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  28.48 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  32.6 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  28.63 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  28.63 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  32.69 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.33 
 
 		 757 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  30.2 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  30.68 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  30.2 
 
 		 341 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  28.03 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  28.03 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.33 
 
 		 757 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 757 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>