More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1858 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1858  patatin  100 
 
 		 344 aa  707    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  60.18 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  55.95 
 
 		 340 aa  381  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  53.55 
 
 		 384 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  51.3 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  53.33 
 
 		 348 aa  345  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  48.14 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  43.3 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  41.69 
 
 		 341 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  41.69 
 
 		 341 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  41.62 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  42.24 
 
 		 349 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  42.24 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  42.12 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  42.65 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  42.65 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  40.22 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  42.45 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  43.2 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  39.71 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  42.77 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  41.88 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  42.35 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  43.24 
 
 		 414 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  43.24 
 
 		 414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  39.62 
 
 		 357 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  41.14 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  42.35 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  39.94 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  39.94 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  40.94 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  39.03 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  42.32 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  39.13 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  40.52 
 
 		 341 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  41.32 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  39.07 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  41.14 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  41.57 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  37.64 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  41.74 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  39.66 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  37.61 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  42.64 
 
 		 315 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  42.2 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  37.64 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  37.01 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  37.57 
 
 		 348 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  39.32 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  38.1 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  35.31 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  35.02 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  35.44 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  34.05 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  32.48 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  27.33 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  36.5 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  31.45 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  31.89 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  26.72 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  31.42 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.79 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.22 
 
 		 763 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  29.45 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  29.18 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  27.41 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  27.41 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  27.53 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 765 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  28.17 
 
 		 377 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  25.91 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  30.04 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  27.37 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  26.71 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  28.92 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.19 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  26.25 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  28 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  27.8 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.25 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  30.11 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  26.91 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  27.68 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  24.73 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  24.82 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.55 
 
 		 757 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.45 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  28.53 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.77 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.77 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.77 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.45 
 
 		 757 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.34 
 
 		 757 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  26.28 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.77 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  26.38 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  24.33 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  26.38 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  25.97 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  25.97 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>