More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4379 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  84.35 
 
 		 377 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  100 
 
 		 420 aa  866    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  100 
 
 		 420 aa  866    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  66.4 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  60.98 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  60.98 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  63.44 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  63.44 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  63.44 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  63.44 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  63.44 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  63.44 
 
 		 390 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  63.71 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  63.17 
 
 		 412 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  62.63 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  61.56 
 
 		 405 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  61.56 
 
 		 405 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  61.56 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  61.56 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  61.56 
 
 		 405 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  62.1 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  59.26 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  57.48 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  55.28 
 
 		 417 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  54.86 
 
 		 427 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  54.62 
 
 		 423 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  51.32 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  50.27 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  49.2 
 
 		 403 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  48.17 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  44.95 
 
 		 378 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  47.45 
 
 		 389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  48.27 
 
 		 384 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  47.03 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  47.15 
 
 		 390 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  48.03 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  48.38 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  45.71 
 
 		 379 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  46.67 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  46.57 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  47.58 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  43.02 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  49.1 
 
 		 390 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  42.16 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  39.75 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  39.84 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  39.73 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  40.48 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  45.4 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  40.33 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  39.89 
 
 		 386 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  39.63 
 
 		 382 aa  249  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  36.91 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  38.07 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  38.84 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  38.84 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  37.95 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  37.4 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  39.02 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  37.91 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  37.91 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  35.76 
 
 		 365 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.96 
 
 		 765 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  35.82 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  36.34 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  35.34 
 
 		 358 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  34.76 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  34.57 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.99 
 
 		 763 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  34.29 
 
 		 341 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.12 
 
 		 777 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.69 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.69 
 
 		 757 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.69 
 
 		 757 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.69 
 
 		 757 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.15 
 
 		 757 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.69 
 
 		 757 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.69 
 
 		 757 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.69 
 
 		 757 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  36.09 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  32.18 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  32.7 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  33.47 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  27.12 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  27.12 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  32.57 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  34.16 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  33.33 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  31.14 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  29 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  30.77 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  34.17 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  30.08 
 
 		 346 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  30.13 
 
 		 360 aa  90.1  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  30.86 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  25.71 
 
 		 355 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  31.71 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  30.86 
 
 		 375 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  27.76 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  27.76 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>