More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0018 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  98.21 
 
 
412 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  84.31 
 
 
405 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  84.31 
 
 
405 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  84.31 
 
 
405 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  98.46 
 
 
390 aa  802    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  98.21 
 
 
412 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  98.21 
 
 
412 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  98.21 
 
 
412 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  84.31 
 
 
405 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  100 
 
 
390 aa  813    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  84.31 
 
 
405 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  98.21 
 
 
412 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  84.31 
 
 
405 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  97.95 
 
 
412 aa  800    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  84.31 
 
 
405 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  72.31 
 
 
412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  71.09 
 
 
412 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  69.09 
 
 
417 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  63.71 
 
 
420 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  63.71 
 
 
420 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  62.57 
 
 
377 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  59.89 
 
 
442 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  57.51 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  53.39 
 
 
427 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  54.86 
 
 
417 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  53.75 
 
 
423 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  53.62 
 
 
410 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  49.33 
 
 
389 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  51.53 
 
 
390 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  47.57 
 
 
378 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  48.6 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  47.55 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  47.27 
 
 
384 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  47.98 
 
 
374 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  47.14 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  45.25 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  45.2 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  50.53 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  46.09 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  46.7 
 
 
378 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  45.78 
 
 
390 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  47.84 
 
 
391 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  47.43 
 
 
385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  43.94 
 
 
384 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  45.43 
 
 
394 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  40.43 
 
 
418 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  41.08 
 
 
400 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  42.02 
 
 
371 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  41.74 
 
 
371 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  40.27 
 
 
399 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  41.55 
 
 
382 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  39.57 
 
 
386 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  39.61 
 
 
387 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  38.97 
 
 
399 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  39.68 
 
 
387 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  39.35 
 
 
379 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  38.3 
 
 
386 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  38.03 
 
 
386 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  40.23 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  39.38 
 
 
379 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  39.94 
 
 
379 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  36.66 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  37.95 
 
 
357 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  36.29 
 
 
358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  35.23 
 
 
341 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  35.61 
 
 
341 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  35.33 
 
 
341 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  37.01 
 
 
356 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.61 
 
 
763 aa  186  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.89 
 
 
765 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  32.39 
 
 
376 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.59 
 
 
777 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  28.81 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.47 
 
 
757 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.47 
 
 
757 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  28.77 
 
 
334 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.47 
 
 
757 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.47 
 
 
757 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.88 
 
 
757 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.89 
 
 
757 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.89 
 
 
757 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.87 
 
 
757 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  29.17 
 
 
346 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  29.17 
 
 
375 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  29.45 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  26.46 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  28.57 
 
 
382 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  27.36 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  29.11 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  26.71 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  26.71 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  30.03 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  27.86 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  26.44 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  30.16 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  28.07 
 
 
349 aa  90.1  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  29.45 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  27.53 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  28.22 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.37 
 
 
377 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>