283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3155 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  94.42 
 
 
412 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  79.81 
 
 
417 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  100 
 
 
412 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  69.27 
 
 
412 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  69.27 
 
 
412 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  69.27 
 
 
412 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  69.27 
 
 
412 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  69.27 
 
 
412 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  69.02 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  72.31 
 
 
390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  72.31 
 
 
390 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  70.43 
 
 
405 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  67.68 
 
 
405 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  67.68 
 
 
405 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  69.89 
 
 
405 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  69.89 
 
 
405 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  69.89 
 
 
405 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  70.7 
 
 
405 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  60.98 
 
 
420 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  60.98 
 
 
420 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  64.67 
 
 
377 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  58.88 
 
 
429 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  59.26 
 
 
442 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  56.28 
 
 
417 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  53.28 
 
 
427 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  52.45 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  50.59 
 
 
410 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  52.39 
 
 
390 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  49.87 
 
 
389 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  47.72 
 
 
378 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  50.4 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  47.83 
 
 
403 aa  329  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  50.14 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  48.52 
 
 
390 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  46.34 
 
 
387 aa  323  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  45.8 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  50.28 
 
 
390 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  48.13 
 
 
374 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  42.97 
 
 
378 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  46.97 
 
 
391 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  46.48 
 
 
382 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  48.13 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  42.51 
 
 
384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  42.61 
 
 
385 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  39.59 
 
 
387 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  40.36 
 
 
418 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  39.78 
 
 
382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  39.47 
 
 
400 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  38.2 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  38.46 
 
 
399 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  39.33 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  38.16 
 
 
371 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  38.16 
 
 
371 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  37.95 
 
 
386 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  42.18 
 
 
394 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  37.67 
 
 
386 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  38.5 
 
 
399 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  39.66 
 
 
379 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  40.69 
 
 
365 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  39.33 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  39.18 
 
 
379 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  38.16 
 
 
379 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  33.81 
 
 
358 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  34.39 
 
 
341 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  32.76 
 
 
341 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  33.62 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  32.47 
 
 
341 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  33.24 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.2 
 
 
763 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.86 
 
 
765 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  32.29 
 
 
376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.69 
 
 
777 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.86 
 
 
334 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  28.57 
 
 
339 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.83 
 
 
757 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.83 
 
 
757 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.83 
 
 
757 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.83 
 
 
757 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.83 
 
 
757 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.83 
 
 
757 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.83 
 
 
757 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.64 
 
 
757 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  29.26 
 
 
341 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  29.26 
 
 
341 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  31.12 
 
 
375 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  30.51 
 
 
414 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  30.86 
 
 
346 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  31.08 
 
 
382 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  30.29 
 
 
382 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  30.17 
 
 
414 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  29.9 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.4 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  29.7 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  31.38 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  28.42 
 
 
349 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  28.68 
 
 
355 aa  92.8  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  28.7 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  27.93 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  27.71 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  27.93 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>