More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5355 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  100 
 
 		 382 aa  776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  79.9 
 
 		 386 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  69.21 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  61.84 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  66.18 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  66.18 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  53.59 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  55.82 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  49.86 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  47.49 
 
 		 343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  45.4 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  45.4 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  45.03 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  46.36 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  48.43 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  47.02 
 
 		 375 aa  308  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  46.75 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  44.73 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  46.45 
 
 		 349 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  46.06 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  47.32 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  46.15 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  47.63 
 
 		 349 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  45.2 
 
 		 444 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  43.81 
 
 		 349 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  45.35 
 
 		 347 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  46.18 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  46.15 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  46.09 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  46.38 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  45.62 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  46.67 
 
 		 350 aa  282  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  42.74 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  41.19 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  46.27 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  43.84 
 
 		 405 aa  276  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  43.77 
 
 		 362 aa  272  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  47.2 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  42.18 
 
 		 340 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  44.95 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  43.2 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  42.69 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  44.81 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  42.47 
 
 		 341 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  44.19 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  40.76 
 
 		 348 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  42.69 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  42.03 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  43.11 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  39.08 
 
 		 351 aa  209  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  35.86 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  38.9 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  34.29 
 
 		 470 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  39.84 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  33.75 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  32.94 
 
 		 442 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  35.67 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  34.98 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  31.4 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  29.49 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  30.59 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  32.3 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  30.77 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  30.69 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  30.34 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 		 763 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  31.85 
 
 		 339 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  31.85 
 
 		 334 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  29.28 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 		 765 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.87 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  31.53 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  29.73 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  31.3 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.93 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  30.29 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  29.73 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  32.17 
 
 		 412 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  28.9 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  28.9 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  28.9 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  29.46 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  28.9 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  28.9 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  28.9 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  27.59 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  28.9 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.27 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  27.59 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  27.59 
 
 		 405 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.26 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  30.07 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  30.24 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  27.59 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  27.59 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  27.59 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  31.62 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  28.97 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.62 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>