282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  100 
 
 
340 aa  691    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  59.41 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  55.95 
 
 
344 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  55.19 
 
 
384 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  55.12 
 
 
362 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  51.61 
 
 
348 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  46.26 
 
 
349 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  50.57 
 
 
352 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  46.53 
 
 
349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  46.53 
 
 
349 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  45.61 
 
 
353 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  45.24 
 
 
349 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  42.73 
 
 
355 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  44.74 
 
 
358 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  45.24 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  39.22 
 
 
341 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  39.22 
 
 
341 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  43.2 
 
 
375 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  44.91 
 
 
346 aa  275  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  44.54 
 
 
349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  45.51 
 
 
346 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  40.9 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  43.67 
 
 
375 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  44.35 
 
 
405 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  42.99 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  42.18 
 
 
382 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  43.47 
 
 
341 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  42.51 
 
 
382 aa  258  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  40.45 
 
 
444 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  42.69 
 
 
414 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  42.77 
 
 
346 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  42.77 
 
 
346 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  41.37 
 
 
360 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  38.12 
 
 
354 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  39.94 
 
 
359 aa  255  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  42.69 
 
 
414 aa  255  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  42.86 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  41.48 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  41.35 
 
 
345 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  42.9 
 
 
350 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  40.39 
 
 
394 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  41.11 
 
 
343 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  42.98 
 
 
433 aa  241  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  38.1 
 
 
357 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  43.54 
 
 
347 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  41.51 
 
 
315 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  35.92 
 
 
342 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  42.68 
 
 
346 aa  213  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  34.29 
 
 
348 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  35.8 
 
 
346 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  35.28 
 
 
470 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  35.76 
 
 
370 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  36.72 
 
 
351 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  36.62 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  33.23 
 
 
442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  29.31 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  32.62 
 
 
321 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  29.38 
 
 
349 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  29.88 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  33.57 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  25.07 
 
 
356 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  30.38 
 
 
330 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  28.26 
 
 
371 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  31.71 
 
 
379 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
763 aa  99.4  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  32.69 
 
 
378 aa  99  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  31.54 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  26.56 
 
 
427 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  31.87 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  32.08 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  32.03 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  31.45 
 
 
379 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.55 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  28.09 
 
 
371 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  28.09 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  31.79 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.21 
 
 
339 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  30.15 
 
 
385 aa  93.2  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  28.11 
 
 
423 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.2 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  27.61 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  25.79 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.44 
 
 
765 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.83 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  32.15 
 
 
386 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.71 
 
 
757 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  27.15 
 
 
412 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  28.88 
 
 
399 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  26.41 
 
 
417 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  27.59 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  26.28 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.77 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  30.98 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  31.19 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  28.09 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  27.72 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  27.72 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  27.72 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  27.72 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  27.72 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>