213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1824 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1824  Patatin  100 
 
 
342 aa  694    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  58.81 
 
 
321 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  41.05 
 
 
349 aa  255  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  45.29 
 
 
442 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  45.94 
 
 
321 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  38.78 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  38.86 
 
 
356 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  41.46 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  36.49 
 
 
371 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  37.64 
 
 
353 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  35.65 
 
 
365 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  37.13 
 
 
349 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  37.13 
 
 
349 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  37.13 
 
 
343 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  36.42 
 
 
349 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  33.82 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  36.8 
 
 
346 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  35.8 
 
 
355 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  36.97 
 
 
347 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  36 
 
 
382 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  33.33 
 
 
346 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  34.88 
 
 
345 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  38.6 
 
 
386 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  33.13 
 
 
354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  34.4 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  35.65 
 
 
375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  35.44 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  36.04 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  35.14 
 
 
346 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  32.25 
 
 
349 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  34.94 
 
 
350 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  36.42 
 
 
358 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  33.15 
 
 
394 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  32.77 
 
 
405 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  32.86 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  32.85 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  32.66 
 
 
444 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  32.34 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  33.53 
 
 
346 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  34.25 
 
 
382 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  32.57 
 
 
414 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  32.44 
 
 
341 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  34.05 
 
 
360 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  32.65 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  31.67 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  33.43 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  32.49 
 
 
433 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  31.93 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  36.5 
 
 
344 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  30.21 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  32.77 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  32.65 
 
 
375 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  34.52 
 
 
348 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  33.57 
 
 
340 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  30 
 
 
384 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  28.57 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  32.72 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  31.44 
 
 
346 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  31.07 
 
 
309 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  32.26 
 
 
351 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.16 
 
 
763 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  31.34 
 
 
352 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  29.75 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.82 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  33.08 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.02 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  30.3 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.04 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.23 
 
 
765 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  41.26 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  28.28 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.66 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  29.89 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  38.19 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  41.91 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  26.98 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  26.98 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  38.13 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  29.45 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  31.03 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  31.03 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  29.29 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  29.7 
 
 
403 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  31.38 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  29.88 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.47 
 
 
777 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  31.78 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  36.81 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  38.89 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  27.97 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  30.42 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  27.8 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  30.42 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  29.24 
 
 
417 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  29.54 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  30.07 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.18 
 
 
757 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  30.07 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>