More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1886 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1886  patatin  100 
 
 		 346 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  55.13 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  52.66 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  52.08 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  55.82 
 
 		 382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  54.28 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  52.11 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  53.73 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  52.87 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  51.33 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  50.15 
 
 		 354 aa  349  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  49.13 
 
 		 353 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  49.28 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  51.66 
 
 		 346 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  49.25 
 
 		 341 aa  341  8e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  49.25 
 
 		 341 aa  341  8e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  48.66 
 
 		 375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  56.12 
 
 		 386 aa  338  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  48.97 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  47.65 
 
 		 349 aa  335  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  50.75 
 
 		 341 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  52.84 
 
 		 414 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  48.67 
 
 		 349 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  52.84 
 
 		 414 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  52.54 
 
 		 382 aa  329  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  51.25 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  50.45 
 
 		 347 aa  325  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  48.69 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  46.55 
 
 		 357 aa  315  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  44.7 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  47.71 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  46.7 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  43.3 
 
 		 444 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  45 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  44.72 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  45.58 
 
 		 345 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  44.86 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  45.59 
 
 		 383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  42.9 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  43.29 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  44.87 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  42.7 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  45.51 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  43.03 
 
 		 362 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  43.77 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  42.77 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  41.23 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  42.86 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  43.48 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  40.7 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  38.57 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  39.65 
 
 		 370 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  35.96 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  37.4 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  35.24 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  34.55 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  31.52 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  33.33 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  30.77 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  31.98 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  33.84 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  30.34 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.48 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.71 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  27.22 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.65 
 
 		 763 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  29.19 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  30.97 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.71 
 
 		 765 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  31.85 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  32.71 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  30.4 
 
 		 387 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  30.86 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  32.06 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  28.36 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  30.3 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  33.98 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  31.52 
 
 		 384 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  28.3 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  27.33 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  33.2 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  27.33 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  28.68 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  28.96 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  28.3 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  31.92 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  31.03 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  29.41 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  36.07 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  28.35 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  28.35 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  29.55 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  29.48 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.51 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  30.08 
 
 		 420 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  30.08 
 
 		 420 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  28.14 
 
 		 405 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  28.14 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.86 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>