More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0810 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0810  Patatin  100 
 
 
347 aa  720    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  62.82 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  54.33 
 
 
375 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  53.59 
 
 
382 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  52.66 
 
 
346 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  54.93 
 
 
382 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  55.65 
 
 
414 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  55.65 
 
 
414 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  51.95 
 
 
343 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  53.89 
 
 
386 aa  359  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  49.85 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  47.6 
 
 
355 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  48.1 
 
 
359 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  48.79 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  46.55 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  46.55 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  46.02 
 
 
375 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  48.31 
 
 
444 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  46.5 
 
 
345 aa  322  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  48.6 
 
 
394 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  47.59 
 
 
353 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  46.99 
 
 
349 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  45.36 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  45.81 
 
 
349 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  46.39 
 
 
349 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  45.08 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  46.08 
 
 
349 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  46.55 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  46.97 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  46.38 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  47.31 
 
 
433 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  42.98 
 
 
347 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  44.67 
 
 
350 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  43.63 
 
 
365 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  43.41 
 
 
383 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  45.26 
 
 
341 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  41.71 
 
 
384 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  41.9 
 
 
346 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  43.77 
 
 
349 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  44.24 
 
 
347 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  40.9 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  41.04 
 
 
362 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  40.22 
 
 
344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  41.23 
 
 
342 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  42.26 
 
 
315 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  41.3 
 
 
348 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  38.73 
 
 
348 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  39.34 
 
 
352 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  40.82 
 
 
351 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  35.28 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  33.33 
 
 
470 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  36.07 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  33.63 
 
 
370 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  35.46 
 
 
309 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  33.82 
 
 
342 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  30.43 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  30.49 
 
 
442 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  32.52 
 
 
321 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  29.31 
 
 
354 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  31.42 
 
 
349 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  29.69 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.69 
 
 
389 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  28.7 
 
 
365 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  27.63 
 
 
371 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  26.69 
 
 
356 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.45 
 
 
763 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.91 
 
 
334 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.88 
 
 
339 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  28.27 
 
 
442 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  25.38 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  25.38 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  29.31 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.27 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  30.12 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  30.43 
 
 
384 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  30.43 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.66 
 
 
765 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  28.37 
 
 
399 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  28.47 
 
 
379 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  27.94 
 
 
429 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  29.92 
 
 
417 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  32.87 
 
 
379 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  27.92 
 
 
412 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  28.85 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.44 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.44 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.44 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.44 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.44 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.44 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.44 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  26.44 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  27.92 
 
 
405 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  28.67 
 
 
378 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  27.92 
 
 
405 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  27.55 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  26.96 
 
 
405 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  27.48 
 
 
418 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  27.17 
 
 
405 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  27.17 
 
 
405 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>