More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1038 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1038  patatin  100 
 
 		 343 aa  699    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  55.33 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  53.55 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  54.68 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  51.95 
 
 		 347 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  52.11 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  52.06 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  47.01 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  47.01 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  52.37 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  52.37 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  52.85 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  48.95 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  49.25 
 
 		 355 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  53.94 
 
 		 433 aa  342  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  52.2 
 
 		 375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  49.11 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  48.7 
 
 		 357 aa  332  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  47.66 
 
 		 444 aa  331  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  49.4 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  47.49 
 
 		 382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  46.8 
 
 		 359 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  50.76 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  52.6 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  49.72 
 
 		 405 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  49.85 
 
 		 350 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  47.9 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  48.44 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  48.44 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  48.24 
 
 		 414 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  46.2 
 
 		 343 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  47.69 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  48.67 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  50.15 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  47.94 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  47.55 
 
 		 365 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  48 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  45.69 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  50.32 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  43.1 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  43.36 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  45.24 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  43.3 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  43.1 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  43.48 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  44.57 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  43.07 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  44.84 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  40.62 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  40.85 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  39.13 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  40.63 
 
 		 470 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  39.43 
 
 		 370 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  39.22 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  34.24 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  37.13 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  34.86 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  36.92 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  31.53 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  28.94 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  27.5 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  28.61 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  29.08 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  30 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  29.97 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  28.4 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  30.77 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  28.4 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  33.57 
 
 		 403 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  33.33 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.71 
 
 		 763 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  31.15 
 
 		 389 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  33.33 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  28.25 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  31.33 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  30.1 
 
 		 387 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  31.7 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  30.86 
 
 		 387 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  32.52 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  30.92 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  30.57 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  31.3 
 
 		 379 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  29.54 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  31.58 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  27.57 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  28.29 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  28.29 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  26.46 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  28.06 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  31.51 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  31.09 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  28.24 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  27.24 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  28.24 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.6 
 
 		 757 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.6 
 
 		 757 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.6 
 
 		 757 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.53 
 
 		 765 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.6 
 
 		 757 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.3 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>