180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3988 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  100 
 
 		 354 aa  729    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  46.51 
 
 		 356 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  43.77 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  41.29 
 
 		 365 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  41.98 
 
 		 349 aa  262  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  42.43 
 
 		 442 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  42.27 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  38.78 
 
 		 342 aa  222  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  36.92 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  34.09 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  31.87 
 
 		 357 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  31.4 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  30.77 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  31.4 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  30.75 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  29.31 
 
 		 347 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  30.7 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  33.56 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  30.41 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  30.41 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  31.4 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  30.56 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  29.74 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  29.41 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  31.4 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  30.59 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  28.9 
 
 		 365 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  28.99 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  30.65 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  31.44 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  28.61 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  29.01 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  27.22 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  27.64 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  30.4 
 
 		 405 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  28.94 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  30.09 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  27.95 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  28.49 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  28.81 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  28.29 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  28.12 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  28.28 
 
 		 444 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  30.64 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  30.14 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  29.59 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  28.29 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  28.49 
 
 		 348 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  30.14 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  29.88 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  29.08 
 
 		 383 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  29.19 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  32.61 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  26.46 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  26.72 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  28.12 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  32.2 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  26.82 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  30.22 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  29.19 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  28.21 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  28.03 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  28.41 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  31.41 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  30.97 
 
 		 470 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.87 
 
 		 763 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  39.44 
 
 		 379 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  29.52 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.71 
 
 		 765 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  36.88 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  31.94 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.37 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  29.2 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.32 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  30.86 
 
 		 382 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  31.09 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.14 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  29.28 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  29.34 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  26.56 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  30.42 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  27.3 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  27.95 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  30.77 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  30 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  37.1 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  25.66 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  25.66 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  28.41 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  29.52 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  29.34 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  28.68 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  25.84 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  35.58 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  35.21 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  32.63 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  32.63 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  27.9 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  27.9 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  28.26 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>