193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1814 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1814  patatin  100 
 
 		 351 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  55.07 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  50.57 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  50.72 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  43.79 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  43.06 
 
 		 360 aa  259  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  42.61 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  43.7 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  44.44 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  42.33 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  42.33 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  42.33 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  43.97 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  41.41 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  41.64 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  42.45 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  40.34 
 
 		 349 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  43.65 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  43.9 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  41.91 
 
 		 433 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  41.31 
 
 		 359 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  43.48 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  38.66 
 
 		 341 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  38.66 
 
 		 341 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  40.4 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  40.82 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  43.9 
 
 		 350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  39.66 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  40.95 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  40.95 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  39.63 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  40.33 
 
 		 357 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  39.37 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  39.2 
 
 		 345 aa  222  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  40.52 
 
 		 341 aa  222  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  39.72 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  40.17 
 
 		 375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  42.32 
 
 		 347 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  41.19 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  38.57 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  38.97 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  38.97 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  35.96 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  39.71 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  36.49 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  39.76 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  35.51 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  36.91 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  35.44 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  36.72 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  36.61 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  35.45 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  39.41 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  35.04 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  35.5 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  28.77 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  28.98 
 
 		 321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  28.18 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  31.76 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  32.26 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  28.61 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  30.41 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  30.29 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  26.89 
 
 		 365 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  34.91 
 
 		 384 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.39 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  30.6 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  29.02 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.07 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.88 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  28.62 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  31.25 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  29.51 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  29.31 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.82 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  30.15 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  28.28 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  31.36 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.78 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  31.25 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  27.62 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.48 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  29.9 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  30 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 765 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.04 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  27.76 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  27.68 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  28.21 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  28.21 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  28.62 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  28.37 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  26.76 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  29.09 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  27.74 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  28.68 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  29.81 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  26.98 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  27.8 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  26.65 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>