More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4147 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  100 
 
 		 387 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  67.72 
 
 		 387 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  65.52 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  54.67 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  54.19 
 
 		 379 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  54.7 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  54.42 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  52.56 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  50 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  52.75 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  52.69 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  41.4 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  41.23 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  39.44 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  42.98 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  39.52 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  40.33 
 
 		 420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  40.33 
 
 		 420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  39.33 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  38.29 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  39.43 
 
 		 382 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  39.42 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  39.42 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  39.42 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  39.42 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  39.42 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  39.42 
 
 		 412 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  43.02 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  39.77 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  39.68 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  38.42 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  40.06 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  38.66 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  41.71 
 
 		 387 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  38.27 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  38.74 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  40.06 
 
 		 403 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  38.02 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  42.74 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  38.9 
 
 		 427 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  37.89 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  37.89 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  41.34 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  38.31 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  39.71 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  37.14 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  41.95 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  37.47 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  37.47 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  37.47 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  42.74 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  37.37 
 
 		 405 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  39.03 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  41.97 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  35.12 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  34.85 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  39.15 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  35.29 
 
 		 371 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  35 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  39.52 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  37.5 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36 
 
 		 765 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.85 
 
 		 763 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  33.62 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  32.56 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  33.43 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  33.43 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  32.27 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.29 
 
 		 757 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.29 
 
 		 757 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.29 
 
 		 757 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  31.49 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  34.39 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.01 
 
 		 757 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.01 
 
 		 757 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.01 
 
 		 757 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.01 
 
 		 757 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.14 
 
 		 777 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.9 
 
 		 757 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  34.1 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  30.26 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  31.09 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  33.58 
 
 		 349 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  31.41 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.37 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  31.41 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  30.3 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  31 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  31.54 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  29.31 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  30.24 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  28.38 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  30.35 
 
 		 349 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  28.21 
 
 		 346 aa  96.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  32.27 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  31.08 
 
 		 386 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  32.14 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  32.09 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  31.13 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  28.36 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>