More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2265 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  806    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  98.19 
 
 
386 aa  797    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  40.66 
 
 
410 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  38.27 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  40.56 
 
 
384 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  41.32 
 
 
390 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  38.5 
 
 
417 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  40.53 
 
 
379 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  38.48 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  37.67 
 
 
412 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  39.53 
 
 
417 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  39.44 
 
 
403 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  39.11 
 
 
405 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  39.78 
 
 
387 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  38.83 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  38.83 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  38.4 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  40.39 
 
 
427 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  38.83 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  38.83 
 
 
405 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  37.5 
 
 
382 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  40.46 
 
 
371 aa  262  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  40.46 
 
 
371 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  36.6 
 
 
378 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  37.6 
 
 
384 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  38.03 
 
 
412 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  38.03 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  38.03 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  38.03 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  38.03 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  38.03 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  38.03 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  38.03 
 
 
390 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  38.62 
 
 
385 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  37.4 
 
 
420 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  37.4 
 
 
420 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  37.22 
 
 
442 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  37.81 
 
 
379 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  37.9 
 
 
378 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  37.36 
 
 
429 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  38.27 
 
 
378 aa  255  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  38.66 
 
 
399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  38.69 
 
 
391 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  36.41 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  34.85 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  36.71 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  37.27 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  36.84 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  39.66 
 
 
385 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  39 
 
 
423 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  38.1 
 
 
374 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  34.6 
 
 
377 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  35.81 
 
 
386 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  36.07 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  36.83 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  39.2 
 
 
405 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  35.81 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  34.84 
 
 
418 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  35.99 
 
 
382 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  38.74 
 
 
394 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.31 
 
 
765 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  39.04 
 
 
390 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  32.56 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.15 
 
 
763 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  33.33 
 
 
365 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  31.5 
 
 
341 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  33.72 
 
 
356 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  30.61 
 
 
341 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  30.32 
 
 
341 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  31.79 
 
 
357 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.65 
 
 
777 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.09 
 
 
757 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 
757 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 
757 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 
757 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 
757 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.41 
 
 
757 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.41 
 
 
757 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.12 
 
 
757 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  34.27 
 
 
339 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  34.55 
 
 
334 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  29.25 
 
 
376 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  28.31 
 
 
340 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  29.21 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  29.21 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  30.43 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  29.6 
 
 
414 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  29.21 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  29.18 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  26.59 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  29.24 
 
 
414 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  29.86 
 
 
444 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  27.46 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  24.91 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  26.4 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  27.72 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  27.72 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  25.45 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  28.62 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  29.39 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>