More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3431 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3431  patatin  100 
 
 		 394 aa  793    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  55.74 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  50.7 
 
 		 389 aa  362  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  46.83 
 
 		 378 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  51.37 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  47.28 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  50.98 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  45.87 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  48.94 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  46.51 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  47.62 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  44.26 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  44.22 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  44.81 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  50.6 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  45.56 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  45.56 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  45.56 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  45.56 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  45.56 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  45.25 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  45.56 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  45.43 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  44.82 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  43.22 
 
 		 405 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  43.22 
 
 		 405 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  43.99 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  43.22 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  43.22 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  43.22 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  43.65 
 
 		 412 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  43.04 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  43.04 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  41.99 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  42.16 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  46.39 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  45.01 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  46.13 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  43.06 
 
 		 427 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  41.9 
 
 		 417 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  42.22 
 
 		 423 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  45.68 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  42.09 
 
 		 442 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  47.29 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  44.99 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  42.9 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  41.54 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  39.08 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  39.36 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  39.34 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  39.07 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  39.52 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  38.74 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  37.5 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  39.88 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  44.81 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  44.19 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  43.87 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  37.11 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  40.34 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  39.81 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 		 763 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.96 
 
 		 765 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  37.79 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.89 
 
 		 777 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  34.9 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  36.14 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  35.73 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  34.43 
 
 		 341 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  34.43 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  36.92 
 
 		 357 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.15 
 
 		 757 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.15 
 
 		 757 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.15 
 
 		 757 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.15 
 
 		 757 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.15 
 
 		 757 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.15 
 
 		 757 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.37 
 
 		 757 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.76 
 
 		 757 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  30.81 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  30.9 
 
 		 334 aa  153  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  31.59 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  31.18 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  32.33 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  31.34 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  32.34 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  34.68 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  28.95 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  30.92 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  32.95 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  32.95 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  32.3 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  30.27 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  29.39 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  28.47 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  28.47 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  25.99 
 
 		 349 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  30.74 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  30.69 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>