More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2564 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2564  patatin  100 
 
 		 357 aa  698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  75.89 
 
 		 356 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  63.2 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  62.95 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  62.65 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  61.83 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  39.6 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  37.43 
 
 		 405 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  37.95 
 
 		 390 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  37.57 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  37.57 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  37.57 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  37.57 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  37.57 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  37.57 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  37.15 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  37.29 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  37.67 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  37.15 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  40.41 
 
 		 403 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  38.42 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  36.87 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  36.87 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  36.87 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  36.87 
 
 		 410 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  37.88 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  35.82 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  35.82 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  38.14 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  36.62 
 
 		 390 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  34.68 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  33.62 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  35.18 
 
 		 442 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  36 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  36.84 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  34.87 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  38.25 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  36.8 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  36.42 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  36.94 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  36.2 
 
 		 382 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  35.11 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  31.71 
 
 		 412 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  32.68 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  31.48 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  32.14 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  31.85 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  34.18 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  35.77 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  33.62 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  32.11 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  37.28 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  33.62 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  36.59 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  35.16 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  33.33 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  33.14 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  36.44 
 
 		 386 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  33.33 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  31.79 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  34.64 
 
 		 390 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  31.5 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  34.33 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  33.98 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  36.92 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  34.9 
 
 		 379 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  34.33 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  33.73 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 		 763 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.43 
 
 		 765 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.14 
 
 		 777 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  31.52 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.87 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.54 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.06 
 
 		 757 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.95 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.95 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.95 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.95 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.95 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.95 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.95 
 
 		 757 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  30.34 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  30.71 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4178  hypothetical protein  47.25 
 
 		 122 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  31.06 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  30.42 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  28.71 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  30.68 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  29.45 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  29.2 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  32.52 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  32.52 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  26.8 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  27.07 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  29.67 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  28.2 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.15 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  23.77 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  26.01 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>