290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1960 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1960  patatin  100 
 
 		 417 aa  872    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  79.81 
 
 		 412 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  80.54 
 
 		 412 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  69.09 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  69.35 
 
 		 390 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  69.35 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  69.35 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  69.09 
 
 		 390 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  69.35 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  69.35 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  69.35 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  66.67 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  66.41 
 
 		 405 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  67.44 
 
 		 405 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  67.44 
 
 		 405 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  67.44 
 
 		 405 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  67.44 
 
 		 405 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  66.4 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  66.4 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  67.44 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  63.59 
 
 		 377 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  59.95 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  60.73 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  57.22 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  52.89 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  53.72 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  48.32 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  48.21 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  47.73 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  46.36 
 
 		 378 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  47.72 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  47.97 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  47.97 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  45.92 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  46.88 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  46.22 
 
 		 387 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  48.3 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  42.63 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  47.2 
 
 		 374 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  44.19 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  49.58 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  47.71 
 
 		 385 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  43.33 
 
 		 385 aa  289  8e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  42.25 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  39.68 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  38.87 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  35.95 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  39.06 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  38.5 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  37.77 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  37.53 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  39.89 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  37.6 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  37.6 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  38.74 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  38.74 
 
 		 379 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  35.64 
 
 		 418 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  38.02 
 
 		 387 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  41.29 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  40 
 
 		 365 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  37.43 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  38.61 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  32.97 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.38 
 
 		 765 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.29 
 
 		 763 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  32.56 
 
 		 341 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  31.74 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  31.46 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  33.91 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  31.48 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.88 
 
 		 777 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  30.4 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  29.41 
 
 		 339 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  29.38 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.81 
 
 		 757 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.81 
 
 		 757 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.81 
 
 		 757 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.23 
 
 		 757 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.81 
 
 		 757 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.23 
 
 		 757 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.23 
 
 		 757 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.15 
 
 		 757 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  32.35 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  28.37 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  30.51 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  31.53 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  30.51 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  28.36 
 
 		 346 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  29 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  29 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  30.67 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  30.15 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  27 
 
 		 355 aa  96.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  31.2 
 
 		 377 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  29.79 
 
 		 350 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  29.92 
 
 		 347 aa  93.2  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  30.39 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  28.37 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  27.6 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  27.6 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>