296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5616 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  91.4 
 
 		 349 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  99.43 
 
 		 349 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  100 
 
 		 349 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  72.11 
 
 		 349 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  67.75 
 
 		 353 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  61.83 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  53.45 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  53.45 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  52.92 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  52.37 
 
 		 343 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  50.15 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  49.11 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  48.67 
 
 		 346 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  49.86 
 
 		 405 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  48.66 
 
 		 346 aa  332  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  49.7 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  47.63 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  50.3 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  48.35 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  44.41 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  46.49 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  49.7 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  44.41 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  46.08 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  46.47 
 
 		 349 aa  309  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  46.45 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  46.53 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  47.62 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  46.73 
 
 		 341 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  45.04 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  44.48 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  46.59 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  47.6 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  44.38 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  46.29 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  45.98 
 
 		 315 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  43.84 
 
 		 342 aa  292  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  43.59 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  44.41 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  46.51 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  45.22 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  44.35 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  46.24 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  43.75 
 
 		 394 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  42.24 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  41.21 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  42.45 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  40.58 
 
 		 346 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  41.48 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  42.47 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  41.36 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  38.68 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  38.34 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  33.23 
 
 		 470 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  34.46 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  37.13 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  31.92 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  31.4 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  35.33 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  30.36 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  32.22 
 
 		 330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  30.11 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  28 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  31.19 
 
 		 365 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  32.12 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  30.74 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  30.74 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  31.54 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  31.41 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.21 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.82 
 
 		 765 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  31.45 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  27.46 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  28.44 
 
 		 442 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.42 
 
 		 423 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.78 
 
 		 763 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  29.17 
 
 		 379 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.18 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  27.6 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  27.93 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  26.17 
 
 		 405 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  26.72 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  26.17 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  30.42 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  29 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  29.55 
 
 		 418 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  29 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.44 
 
 		 412 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.44 
 
 		 412 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.44 
 
 		 412 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.44 
 
 		 412 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.44 
 
 		 412 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.44 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  26.92 
 
 		 405 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  27.04 
 
 		 427 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  25.9 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.44 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  25.9 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  28.96 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  25.9 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>