More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2766 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2766  patatin  100 
 
 		 352 aa  701    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  52.42 
 
 		 384 aa  348  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  50.73 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  50.85 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  47.85 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  47.71 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  48.12 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  41.81 
 
 		 358 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  39.34 
 
 		 347 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  40.62 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  38.14 
 
 		 349 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  41.08 
 
 		 353 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  40.28 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  41.36 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  41.36 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  40.51 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  37.04 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  37.04 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  43.06 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  40.6 
 
 		 375 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  41.79 
 
 		 346 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  42.03 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  43.87 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  38.57 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  43.59 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  37.97 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  41.14 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  39.43 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  41.41 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  39.72 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  40.49 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  40.17 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  40.8 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  40.78 
 
 		 433 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  42.32 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  38.64 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  39.22 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  40.34 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  39.22 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  39.55 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  36.41 
 
 		 444 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  37.22 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  37.95 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  41.13 
 
 		 347 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  43.44 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  39.71 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  36.24 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  36.55 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  34.27 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  35.73 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  37.77 
 
 		 470 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  36.34 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  37.02 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  41.2 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  29.91 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  30.1 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  32.42 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  36.4 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  33.1 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  32.22 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  32.22 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  32.03 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  30.56 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  30.82 
 
 		 442 aa  99.4  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  29.71 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  31.37 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  24.93 
 
 		 356 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  31.85 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.85 
 
 		 379 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  32.82 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.62 
 
 		 763 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  26.62 
 
 		 423 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  32.34 
 
 		 387 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  30.8 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  31.94 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  31.58 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  27.8 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  28.17 
 
 		 371 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  26.8 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.98 
 
 		 765 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  28.62 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.83 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.15 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  29.82 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  30.42 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.48 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  28.1 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  32.02 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  28.52 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  30.86 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  31.34 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  30.71 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  31.47 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.09 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  31.35 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  31.25 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  28.73 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  29.3 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  27.94 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>