More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3249 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3249  patatin  100 
 
 		 383 aa  792    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  59.4 
 
 		 362 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  56.67 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  60.18 
 
 		 344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  59.41 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  57.69 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  46.49 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  46.49 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  46.94 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  45.45 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  46.22 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  47.71 
 
 		 352 aa  302  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  44.64 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  43.41 
 
 		 347 aa  290  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  45.59 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  43.36 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  43.62 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  44.38 
 
 		 349 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  44.64 
 
 		 358 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  42.31 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  42.02 
 
 		 346 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  42.02 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  41.19 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  39.94 
 
 		 341 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  39.94 
 
 		 341 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  40.75 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  42.37 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  41.57 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  41.84 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  40.39 
 
 		 444 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  42.69 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  43.11 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  41.08 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  40.58 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  41.25 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  43.9 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  43.7 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  43.11 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  42.04 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  42.15 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  40.62 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  40.97 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  42.43 
 
 		 386 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  43.53 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  44.08 
 
 		 347 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  42.01 
 
 		 315 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  37.5 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  38.15 
 
 		 348 aa  212  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  37.93 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  36.05 
 
 		 346 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  37.32 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  36.49 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  34.73 
 
 		 470 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  37.5 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  30.66 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  30 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  32.53 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  31.51 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  31.19 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  29.08 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  32.73 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  31.82 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.41 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  28.62 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  28.3 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  30.16 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  32.17 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.74 
 
 		 763 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  27.68 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  27.14 
 
 		 442 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  30.94 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  28.37 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  28.37 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  25.92 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  28.68 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  25.76 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  29.5 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  27.42 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  27.01 
 
 		 412 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.66 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.7 
 
 		 757 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  27.01 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  27.01 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  26.71 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  27.01 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  27.01 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  27.01 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.15 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.7 
 
 		 757 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.22 
 
 		 765 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.7 
 
 		 757 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  27.6 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.7 
 
 		 757 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.7 
 
 		 757 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.7 
 
 		 757 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.7 
 
 		 757 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.96 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  28.93 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  27.6 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  27.5 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>