More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0550 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  100 
 
 		 348 aa  700    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  57.69 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  53.33 
 
 		 344 aa  345  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  53.33 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  51.61 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  50.44 
 
 		 362 aa  325  9e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  47.08 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  44.67 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  46.24 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  46.24 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  44.96 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  46.24 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  48.12 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  45.83 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  47.32 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  44.57 
 
 		 343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  43.77 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  44.67 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  43.27 
 
 		 346 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  42.94 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  46.59 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  43.2 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  40.18 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  40.18 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  45.03 
 
 		 350 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  45.14 
 
 		 405 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  44.6 
 
 		 347 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  43.68 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  41.19 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  43.84 
 
 		 346 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  43.03 
 
 		 375 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  44.81 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  38.73 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  44.15 
 
 		 349 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  44.81 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  41.46 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  42.69 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  43.69 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  43.11 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  41.26 
 
 		 345 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  38.21 
 
 		 444 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  41.21 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  39.42 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  40.49 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  42.86 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  39.44 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  38.89 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  44.02 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  37.71 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  38.62 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  39.71 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  37.47 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  35.76 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  39.02 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  30.75 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  30.79 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  34.52 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  28.49 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  30.51 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  31.25 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  31.72 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  28.33 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.86 
 
 		 423 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  29.94 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.25 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.76 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  26.87 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  26.87 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  28.25 
 
 		 379 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  27.09 
 
 		 371 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  29.83 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  29.83 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  29.83 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  30.6 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  26.8 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  27.46 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  31.54 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  26.54 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  26.97 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  28.81 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  28.81 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  27.33 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  28.81 
 
 		 405 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  26.65 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  28.81 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  30.69 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  32.79 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  27.64 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  29.86 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  29.89 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  26.62 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  28.63 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.17 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  31.3 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  28.63 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  27.38 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.39 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  26.1 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  27.46 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>