More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0335 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0848  patatin  88.06 
 
 		 377 aa  662    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  100 
 
 		 377 aa  755    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  64.59 
 
 		 375 aa  497  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 765 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  33.99 
 
 		 442 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  32.52 
 
 		 384 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.73 
 
 		 763 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  32.86 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  34.47 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.17 
 
 		 777 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  33.76 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  35.06 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  31.17 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  25.71 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.04 
 
 		 757 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  34.38 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.76 
 
 		 757 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  31.8 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  25.4 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.04 
 
 		 757 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.04 
 
 		 757 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.04 
 
 		 757 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.04 
 
 		 757 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  28.66 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.04 
 
 		 757 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.04 
 
 		 757 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  35.29 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  30.34 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  35.9 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  34.65 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  27.11 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  34.16 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  34.16 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  34.02 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  34.65 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  30.61 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  28.38 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  29.58 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  28.97 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  30.38 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  30.12 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  29.07 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  30.06 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  32.16 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  32.38 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  34.19 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  28.7 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  28.54 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  32.54 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  31.8 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  32.23 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  30.48 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  33.86 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  31.56 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  29.73 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  31.85 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  30.04 
 
 		 412 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  32.51 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  30.35 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  32.51 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  32.51 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  28.8 
 
 		 418 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  28.89 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  32.51 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  31.67 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  30.94 
 
 		 378 aa  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  31.95 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  32.77 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  30.12 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  29.48 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  29.86 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  30.15 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  27.61 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.83 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  35.14 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.97 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.83 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.83 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.83 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  27.66 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.83 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.83 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  29.73 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  31.08 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  29.71 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  30.8 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  30.8 
 
 		 341 aa  86.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  29.05 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  26.83 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  29.71 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  28.17 
 
 		 344 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  30.68 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  26.24 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  26.24 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  27.99 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  27.88 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  30.68 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  30.68 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  31.62 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  31.88 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>