More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3463 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  61.1 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  54.28 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  53.03 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  52.06 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  47.9 
 
 		 341 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  47.9 
 
 		 341 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  53.33 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  53.01 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  51.06 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  50.76 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  52.2 
 
 		 347 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  50.15 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  50.15 
 
 		 349 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  49.25 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  50.6 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  48.79 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  52.12 
 
 		 350 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  54.24 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  49.85 
 
 		 405 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  51.76 
 
 		 315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  49.85 
 
 		 433 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  44.81 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  43.87 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  46.49 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  46.59 
 
 		 343 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  47.13 
 
 		 375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  48.79 
 
 		 382 aa  288  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  45.51 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  44.74 
 
 		 340 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  46.15 
 
 		 346 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  44.64 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  45.14 
 
 		 346 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  46.69 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  46.27 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  42.78 
 
 		 444 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  46.39 
 
 		 414 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  47.32 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  43.23 
 
 		 342 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  42.05 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  43.07 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  46.27 
 
 		 386 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  41.31 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  44.11 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  40.94 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  42.24 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  40.79 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  41.81 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  42.49 
 
 		 346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  43.39 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  41.48 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  40 
 
 		 346 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  35.56 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  37.55 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  35.21 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  32.56 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  36.42 
 
 		 342 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  36.47 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  30.65 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  34.2 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  29.23 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  31.74 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  30.82 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  34.59 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  31.62 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  31.12 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.46 
 
 		 763 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  33.57 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  30.61 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  33.2 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  31 
 
 		 405 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  30.67 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  30.67 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  30.67 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  33.33 
 
 		 423 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  30.67 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  30.12 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  26.23 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  32.59 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  31.87 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  30.54 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  31.52 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  34.5 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  33.21 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  33.46 
 
 		 387 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  30.03 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  30.03 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  30.03 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  30.03 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  30.03 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  29.83 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.8 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  30.03 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  27.9 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  33.46 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  30.03 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  34.17 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  29.09 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>