More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1281 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1281  patatin  100 
 
 
406 aa  791    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  37.01 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1546  patatin-like phospholipase family protein  28.19 
 
 
305 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0945902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1826  patatin family phospholipase  27.95 
 
 
305 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.9 
 
 
387 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  31.96 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0344  patatin family phospholipase  30.42 
 
 
285 aa  86.7  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.71 
 
 
765 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  30.69 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  29.2 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  28.25 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  29.41 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  28.81 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.56 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 
763 aa  80.1  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  30.29 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  30.77 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  28.9 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  28.43 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  30.77 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  24.91 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  28.78 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  31.19 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  27.73 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  29.68 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  29.79 
 
 
429 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  30.84 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  29.91 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  27.73 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  27.39 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  30.88 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2850  Patatin  28.79 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000110096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  29.49 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  29.3 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  29.49 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  27.98 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  26.73 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  27.67 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  29.49 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  29.49 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  29.49 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  29.49 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  29.49 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  29.49 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  30.84 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  26.73 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  29.95 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  29.95 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  29.95 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  28.16 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  27.83 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  28.5 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 
777 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.52 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  30 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  28.5 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  29.82 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  27.52 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.84 
 
 
738 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.44 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  27.06 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1398  phospholipase, patatin family  25.32 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  27.9 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.84 
 
 
738 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.84 
 
 
738 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  30.6 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  28.37 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  30.6 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.84 
 
 
737 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  28.57 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  29.03 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  27.75 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  26.79 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  28.05 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  28.1 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  28.23 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2977  Patatin  22.97 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  29.49 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  29.31 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  27.78 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.05 
 
 
757 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.05 
 
 
757 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  29.71 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.05 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.05 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2849  phospholipase, patatin family  25.32 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.41074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.05 
 
 
757 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.05 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  25.32 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  29.71 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.05 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  26.58 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.39 
 
 
738 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  32.88 
 
 
736 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  25.91 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  27.15 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  25 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.58 
 
 
728 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  28.24 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>