More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2395 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2395  patatin  100 
 
 
391 aa  776    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  76.19 
 
 
400 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  75.93 
 
 
400 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  74.87 
 
 
400 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  39.37 
 
 
408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  40.21 
 
 
382 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  41.47 
 
 
393 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  42.63 
 
 
382 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  43.7 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  40.9 
 
 
381 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  41.69 
 
 
389 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  41.95 
 
 
389 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  40.71 
 
 
394 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  41.51 
 
 
382 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  41.32 
 
 
382 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  41.05 
 
 
382 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  38.32 
 
 
377 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  40.62 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  39.45 
 
 
391 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  36.68 
 
 
375 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  39.42 
 
 
394 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  39.47 
 
 
390 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  42.64 
 
 
410 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  38.46 
 
 
374 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  36.94 
 
 
380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  39.15 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  38.48 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  38.46 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  39.95 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  38.46 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  37.17 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  38.06 
 
 
374 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  38.58 
 
 
374 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  36.97 
 
 
375 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  38.2 
 
 
383 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  38.32 
 
 
374 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  38.74 
 
 
379 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  38.32 
 
 
374 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  42.82 
 
 
418 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  35.28 
 
 
375 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  40.1 
 
 
422 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  36.91 
 
 
374 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  37.8 
 
 
374 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  40.31 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  41.41 
 
 
412 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  40.05 
 
 
394 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  38.6 
 
 
376 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  38.93 
 
 
422 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  37.76 
 
 
463 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  38.26 
 
 
408 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  38.26 
 
 
408 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  38.26 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  38.13 
 
 
416 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  35.62 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  38.27 
 
 
427 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  38.6 
 
 
408 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  40.61 
 
 
400 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  32.89 
 
 
392 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  38.08 
 
 
408 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  33.07 
 
 
370 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  33.07 
 
 
370 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  33.68 
 
 
383 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  38.26 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  33.6 
 
 
378 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  36 
 
 
410 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  36.1 
 
 
414 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  36.1 
 
 
415 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  36.1 
 
 
414 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  34.17 
 
 
408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  38.57 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  38.57 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  33.91 
 
 
421 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  32.36 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  32.12 
 
 
419 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  33.33 
 
 
419 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  28.07 
 
 
429 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  30.26 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.35 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.92 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  32.76 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  25.07 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.46 
 
 
303 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  25.34 
 
 
339 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  31.28 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  32.05 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.04 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  31.3 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  32.82 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  32.05 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  30.25 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  30.69 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  31.2 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  31.2 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  31.2 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  31.17 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  28.57 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  28.57 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  28.57 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>