More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2182 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2182  patatin  100 
 
 		 293 aa  597  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1826  patatin family phospholipase  29.89 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1546  patatin-like phospholipase family protein  29.89 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0945902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2850  Patatin  28.35 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000110096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  29.14 
 
 		 397 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0732  Patatin  29.21 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  24.91 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3682  Patatin  26.56 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  28.94 
 
 		 753 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.55 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  30.58 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  26.74 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  26.46 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  27.73 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  27.11 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1398  phospholipase, patatin family  26.18 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  26.25 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.49 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2849  phospholipase, patatin family  26.18 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.41074 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  27.35 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  27.35 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  28.89 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  27.14 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  26.48 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  30.2 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  30 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  26.29 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  30.77 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  26.29 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  30.77 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  24.91 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.32 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  26.11 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.09 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  28.08 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.32 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  31.22 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  27.65 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.43 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  25.65 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  27.88 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  27.88 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  27.88 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  27.59 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  27.88 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  26.67 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  26.46 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  27.43 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  25.79 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  28.19 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.83 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  26.55 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  26.91 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  24.92 
 
 		 727 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.78 
 
 		 763 aa  62.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  25.51 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  29.67 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  25.86 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  25.21 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  29.87 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.29 
 
 		 760 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  23.17 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  26.09 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  28.31 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  26.29 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  25.59 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  27.02 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  25.1 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  25.2 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  28.83 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  24.16 
 
 		 751 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  26.62 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  23.72 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  26.46 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  26.58 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  28.57 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  25.88 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  24.58 
 
 		 728 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  25.31 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  29.11 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  24.5 
 
 		 728 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  24.56 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  26.92 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  24.43 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  25.83 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  26.59 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  25.64 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0344  patatin family phospholipase  26.53 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  25.64 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  25.64 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  23.6 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  25.64 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  28.22 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  24.8 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  24.35 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  26.26 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  23.85 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  23.98 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>