More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3983 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1736  patatin  98.95 
 
 		 382 aa  743    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  100 
 
 		 382 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  91.1 
 
 		 382 aa  689    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  96.07 
 
 		 382 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  77.28 
 
 		 390 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  74.54 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  73.23 
 
 		 393 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  71.5 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  68.99 
 
 		 389 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  68.73 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  48.81 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  46.74 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  43.68 
 
 		 382 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  46.7 
 
 		 376 aa  302  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  47.24 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  42.44 
 
 		 378 aa  288  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  39.63 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  42.26 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  47.97 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  45.95 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  43.31 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  43.75 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  43.04 
 
 		 415 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  43.04 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  43.04 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  39.21 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  39.63 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  46.7 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  43.01 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  45.29 
 
 		 412 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  43.04 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  43.04 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  43.8 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  40.99 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  43.04 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  39.52 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  42.19 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  40.47 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  40.21 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  40.21 
 
 		 374 aa  272  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  42.19 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  44.22 
 
 		 425 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  42.78 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  38.16 
 
 		 375 aa  268  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  38.12 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  38.9 
 
 		 374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  43.5 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  39.16 
 
 		 374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  41.58 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  45.36 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  44.92 
 
 		 418 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  39.16 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  39.16 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  39.16 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  41.04 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  41.93 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  39.43 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  44.3 
 
 		 422 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  39.1 
 
 		 376 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  44.33 
 
 		 422 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  42.39 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  42.06 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  42.06 
 
 		 400 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  41.38 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  37.63 
 
 		 379 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  40.1 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  40.31 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  44.26 
 
 		 300 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  44.26 
 
 		 300 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  32.53 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  32.27 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  31.39 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  31.12 
 
 		 419 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  30.81 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  30.88 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  31.55 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  29.32 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.71 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.77 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.98 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  25.41 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  30.43 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.37 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  29.18 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  27.24 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  31.36 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  29.13 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.81 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.48 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  30.64 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  30.04 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  27.73 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  30.57 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.95 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  27.73 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  27.73 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  27.73 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  27.73 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  27.73 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  32.93 
 
 		 796 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>