More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0732 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0732  Patatin  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2850  Patatin  47.11 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000110096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1826  patatin family phospholipase  30.23 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1546  patatin-like phospholipase family protein  30.71 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0945902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  30.69 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  30.55 
 
 		 397 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  30.83 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  24.43 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  22.61 
 
 		 341 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  24.21 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2977  Patatin  26.06 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  25.79 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  22.58 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  24.79 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  25 
 
 		 339 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  30.28 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  29.58 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  23.28 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3682  Patatin  23.79 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  24.35 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  24.38 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  31.34 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  23.33 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  21.3 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  24.38 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  21.3 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  23.11 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  23.59 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 748 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  22.57 
 
 		 347 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1398  phospholipase, patatin family  24.1 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2849  phospholipase, patatin family  23.78 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.41074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  23.78 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  27.66 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  27.66 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  26.72 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  25.35 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  23.98 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  22.97 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  25.23 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  27.9 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  24.54 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  25.96 
 
 		 1588 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  24.73 
 
 		 382 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  23.08 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  24.87 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  21.3 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  29.91 
 
 		 383 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  29.91 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  29.91 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  29.91 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  25.71 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  28.11 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  25.11 
 
 		 353 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  24.89 
 
 		 442 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  28.45 
 
 		 374 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  23.08 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  24.06 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  24.88 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  27.8 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  23.89 
 
 		 433 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  24.06 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  53.7 
 
 		 377 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  22.17 
 
 		 346 aa  52.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  25.44 
 
 		 341 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  25.44 
 
 		 341 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  25.11 
 
 		 350 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0344  patatin family phospholipase  27.27 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  28.24 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  25 
 
 		 740 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  48.15 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  23.5 
 
 		 371 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.44 
 
 		 760 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  28.15 
 
 		 375 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  25.86 
 
 		 374 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  25.86 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  22.92 
 
 		 427 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  25.86 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  21.21 
 
 		 378 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  20 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  23 
 
 		 727 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  23.17 
 
 		 386 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  22.77 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  22.77 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  28.18 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  21.89 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  22.38 
 
 		 385 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  24.63 
 
 		 376 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  25.1 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  23.56 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  25.24 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  27.35 
 
 		 383 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  27.73 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  23.94 
 
 		 394 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  25 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  48.15 
 
 		 377 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  22.94 
 
 		 379 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  22.94 
 
 		 379 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  24.26 
 
 		 410 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>